Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；身份待核实的名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000269`

染色体: Chr07 坐标: 1734065-1736743 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一基因 ID	`SmilChr07G000269`
名称	SmilChr07G000269
描述	lactoylglutathione lyase-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	1734065 - 1736743 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991466`
GeneID	`130991466`
locus_tag	`-`
NCBI 名称	`LOC130991466`
原始查询	`LOC130991466`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	lactoylglutathione lyase-like
产物	lactoylglutathione lyase-like
拟南芥	`AT2G32090` (AT2G32090) Lactoylglutathione lyase / glyoxalase I family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817769] identity=59.85; qcov=0.903; evalue=6.26e-58; confidence=high
水稻	`Os03g0659300` (OsGLYI4) - identity=51.52; qcov=0.89; evalue=6.69e-39; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00903 (Glyoxalase); PF13669 (Glyoxalase_4); PF18029 (Glyoxalase_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991466

打开注释模块

亚细胞定位候选（最多五项）

预测得分表示模型支持程度，不能作为定位概率；所有候选均需实验验证。

方法与数据说明

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定；当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选，预测得分表示模型支持程度，不是校准概率，也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签，应谨慎解读其在植物中的适用性。四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核，原始投票全部一致。

排序	定位位置	预测得分	蛋白 ID
1	细胞质基质	1.00000	`XP_057771690.1`
2	细胞质	0.40000	`XP_057771691.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	参考等位基因	变异等位基因	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:1734344`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B107,B119,B130,B133,C25,C30,D9
`Chr7:1735038`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr7:1735176`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,B54
`Chr7:1735230`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B30,B31,C12
`Chr7:1735242`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B139,B54,C15
`Chr7:1736330`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr7:1736338`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr7:1736467`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B103,B13,B2,C39,C60,D4
`Chr7:1736475`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,C14,C38,C62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771690.1

148 aa

148

Glyoxalase

Glyoxalase_4

PF00903 Glyoxalase 12-134 aa PF13669 Glyoxalase_4 13-127 aa

XP_057771691.1

145 aa

145

Glyoxalase

Glyoxalase_4

Glyoxalase_6

PF00903 Glyoxalase 12-138 aa PF13669 Glyoxalase_4 13-127 aa PF18029 Glyoxalase_6 18-138 aa

蛋白 ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	得分	说明
`XP_057771690.1`	Pfam	`PF00903`	Glyoxalase	Domain	12	134	2e-11	45.1	Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily
`XP_057771690.1`	Pfam	`PF13669`	Glyoxalase_4	Family	13	127	5.9e-09	36.9	Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily
`XP_057771691.1`	Pfam	`PF00903`	Glyoxalase	Domain	12	138	3.9e-13	50.6	Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily
`XP_057771691.1`	Pfam	`PF13669`	Glyoxalase_4	Family	13	127	5.5e-09	37.0	Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily
`XP_057771691.1`	Pfam	`PF18029`	Glyoxalase_6	Domain	18	138	3.4e-05	25.2	Glyoxalase-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915708.1
GTGGATGATTTTGTTCCTTCTTGCCATCTTTCGATTATTTTTTAAGTTTTTTCACAATTTGATTTCAATATTTACAATAAAATAAAATTTGCCTCATTCAAAAAATTAAAGTAAGAAAGAAATATTATTCTTAAATGAGTATGTGTACACGTGGAGAGCGTAGGTGTTACTTGATTGACAGTGAAATGCGTGTCGGCATAGAAAAGAATTCGCCGGTAGCTTAGAAACTGAAAATCTCTTCGCCTCCAAATCCAAGTGGT...

XM_057915707.1
TAAATGAGTATGTGTACACGTGGAGAGCGTAGGTGTTACTTGATTGACAGTGAAATGCGTGTCGGCATAGAAAAGAATTCGCCGGTAGCTTAGAAACTGAAAATCTCTTCGCCTCCAAATCCAAGTGGTAATGGCGGCGGCGGCAGCAGCTCAAGGACCTTGCCTCAATCACATTTCTAGAGAAACGTCTGATATCAAACGCCTCTCTAAATTCTACATGGAGGTTTTTGGGTTTGAGCAAGTAGAGTCTCCAAAGTTCG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080393.1_cds_XP_057771691.1_34714
ATGGCGGCGGCGGCAGCAGCTCAAGGACCTTGCCTCAATCACATTTCTAGAGAAACGTCTGATATCAAACGCCTCTCTAAATTCTACATGGAGGTTTTTGGGTTTGAGCAAGTAGAGTCTCCAAAGTTCGAATTTGAGGTAATATGGTTGAAGCTTGGTTCATCCATGTTGCTGCACCTCATAGAAAGGGACCCCACCGTCATGCTTCCCGAAGGTCCATGGAGCTCCGTGGCGGCTGTGGCAGACCCAAAGAACCTTCC...

lcl|NC_080393.1_cds_XP_057771690.1_34715
ATGGCGGCGGCGGCAGCAGCTCAAGGACCTTGCCTCAATCACATTTCTAGAGAAACGTCTGATATCAAACGCCTCTCTAAATTCTACATGGAGGTTTTTGGGTTTGAGCAAGTAGAGTCTCCAAAGTTCGAATTTGAGGTAATATGGTTGAAGCTTGGTTCATCCATGTTGCTGCACCTCATAGAAAGGGACCCCACCGTCATGCTTCCCGAAGGTCCATGGAGCTCCGTGGCGGCTGTGGCAGACCCAAAGAACCTTCC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057771690.1
MAAAAAAQGPCLNHISRETSDIKRLSKFYMEVFGFEQVESPKFEFEVIWLKLGSSMLLHLIERDPTVMLPEGPWSSVAAVADPKNLPRGHHICFYVPEFDSFVQRVKDKGIPVHEKSQPDGKTKQAFFFDPDGESFLMQNNSSGPILP

XP_057771691.1
MAAAAAAQGPCLNHISRETSDIKRLSKFYMEVFGFEQVESPKFEFEVIWLKLGSSMLLHLIERDPTVMLPEGPWSSVAAVADPKNLPRGHHICFYVPEFDSFVQRVKDKGIPVHEKSQPDGKTKQAFFFDPDGNGLEVSSQMPSL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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