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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000264`

染色体: Chr07 坐标: 1712569-1720228 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000264`
名称	SmilChr07G000264
描述	protein NUCLEOLAR FACTOR 1-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	1712569 - 1720228 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991467`
GeneID	`130991467`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991467`
原始查询	`LOC130991467`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NUCLEOLAR FACTOR 1-like
产物	protein NUCLEOLAR FACTOR 1-like
Arabidopsis	`AT1G17690` (NOF1) U3 small nucleolar RNA-associated protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838345] identity=58.2; qcov=0.907; evalue=5.39e-32; confidence=medium
Rice	`Os05g0295100` - identity=56.7; qcov=0.898; evalue=1.73e-29; confidence=medium
GO	GO:0000462 (maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)); GO:0005730 (nucleolus); GO:0019843 (rRNA binding); GO:0032040 (small-subunit processome); GO:0034511 (U3 snoRNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF06862 (Utp25_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991467

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057771692.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057771692.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771692.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771692.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771692.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:1712780`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	79	A10,A15,A20,A5,B10,B102,B11,B110,B114,B117,B126,B127,B129,B132,B136,B17,B18,B21,B25,B29,B30,B31,B36,B40,B42,B43,B47,B5,B50,B55,B57,B6,B60,B62,B64,B65,B69,B80,B81,B83,B84,B88,B89,B95,C11,C12,C14,C16,C17,C22,C23,C25,C3,C34,C42,C44,C45,C46,C53,C59,C60,C65,C67,C69,C7,C70,C72,C73,C74,C75,C77,C79,C81,C83,C9,D1,D3,D5,D6
`Chr7:1712783`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B25,B81,C16
`Chr7:1712799`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C58,C78,D11
`Chr7:1712812`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	A15,B42,B43,B62,B80,B84,D5
`Chr7:1712836`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B136,B139,B67,C14,C85
`Chr7:1712837`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C25,C28,C54,C55
`Chr7:1713115`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B102
`Chr7:1713115`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B102
`Chr7:1717584`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B30,B8,D5
`Chr7:1717847`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B57,B87
`Chr7:1717872`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B57,B87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771692.1

108 aa

108

Utp25_C

PF06862 Utp25_C 2-100 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771692.1`	Pfam	`PF06862`	Utp25_C	Domain	2	100	4.9e-26	92.3	Utp25, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009091153.1
ATCCGGGTGAAAACGTTGTTGCTGCTTCTCGTTGTGGATAATTTTTGAGAGCATCGCTGGGTCTCCCTCAATCTCCACCAAGACGGCGGTGAAGACGGCAGCGACGGCGAGTGGCGGAGGATTCTCCGCTGGTGGGTGAGGATTCCGCCGAATTCGTCTTGTCCGAGGCTCGGACTCCGAGCAAAATTTCTGGTTTTGAGTGACGGCGAGTGGCGGAGGATTCTGCTAAATTTTACTCTGGTTTTGGGCGTCAAGCATTT...

XM_057915709.1
ATCCGGGTGAAAACGTTGTTGCTGCTTCTCGTTGTGGATAATTTTTGAGAGCATCGCTGGGTCTCCCTCAATCTCCACCAAGACGGCGGTGAAGACGGCAGCGACGGCGAGTGGCGGAGGATTCTCCGCTGGTGGGTGAGGATTCCGCCGAATTCGTCTTGTCCGAGGCTCGGACTCCGAGCAAAATTTCTGGTTTTGAGTGACGGCGAGTGGCGGAGGATTCTGCTAAATTTTACTCTGGTTTTGGGCGTCAAGCATTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991467
ATGGATGGAGTGATGATTTTTGTCAGCTCTTACTCTGAGTATGTACGACTTAGGAATTATTTGAAATCTCAGTCTGCTTTAGTCTGCCTGTTTGGAGAGTATATAAAGCGAAATGAGATTTCTCATGTCAGGGGTGAGTTTTTTAGAGGAGAAAAGAAAATTATGCTCTACACTGAGCGAGCCCATTTCTATTACAGATACAAGGTCTTCCCCAAGATAAAGGATTCTGTTCAGATTCGCGGTGTGAATAATTTGATAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771692.1
MDGVMIFVSSYSEYVRLRNYLKSQSALVCLFGEYIKRNEISHVRGEFFRGEKKIMLYTERAHFYYRYKVFPKIKDSVQIRGVNNLIIYSLPERKEFYPQLTFWKSLIA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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