当前解析结果
SmilChr07G000294| 统一新 Gene ID | SmilChr07G000294 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G000294 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G000294 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 1910203 - 1911193 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130991486 |
|---|---|
| GeneID | 130991486 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130991486 |
| 原始查询 | LOC130991486 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130991486 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057771726.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057771726.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057771726.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057771726.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057771726.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:1910260 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 41 | A11,A20,A5,B11,B118,B124,B13,B136,B14,B21,B24,B35,B36,B39,B4,B41,B45,B53,B61,B64,B66,B80,B83,B88,B93,C10,C12,C15,C21,C22,C24,C32,C33,C39,C46,C49,C55,C59,C67,C69,D10 |
Chr7:1910270 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | B53,C55 |
Chr7:1910270 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B53,C55 |
Chr7:1910271 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B44,C83 |
Chr7:1910275 |
AG |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 16 | A21,A7,B113,B63,B64,B93,C20,C23,C25,C43,C51,C57,C59,C71,C74,C76 |
Chr7:1910500 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B25,B48,C42,C71,D8 |
Chr7:1910618 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 13 | A24,A3,B110,B134,B38,B39,B56,B63,B94,B96,C40,C45,C47 |
Chr7:1910622 |
C |
CA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 14 | A24,A3,B110,B134,B38,B39,B56,B63,B89,B94,B96,C40,C45,C47 |
Chr7:1910644 |
T |
TCC |
2bp_insertion | frameshift_variant | 17 | A24,A3,B110,B134,B38,B39,B56,B63,B89,B94,B96,C12,C24,C40,C45,C47,C52 |
Chr7:1910674 |
AAT |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 32 | A13,A14,A18,B10,B105,B11,B118,B126,B131,B139,B29,B46,B55,B60,B71,B78,C11,C19,C26,C35,C39,C43,C56,C64,C66,C69,C72,C73,C87,C9,D6,D7 |
Chr7:1910678 |
T |
TTC |
2bp_insertion | frameshift_variant | 35 | A13,A14,A18,B10,B105,B11,B111,B118,B126,B131,B139,B29,B45,B46,B55,B60,B71,B78,C11,C19,C26,C35,C39,C43,C53,C56,C64,C66,C69,C72,C73,C87,C9,D6,D7 |
Chr7:1910681 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 14 | A3,B115,B134,B38,B39,B56,B63,B94,B96,C12,C24,C40,C45,C47 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。