当前解析结果
SmilChr07G000292| 统一新 Gene ID | SmilChr07G000292 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G000292 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G000292 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 1887983 - 1888876 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130991487 |
|---|---|
| GeneID | 130991487 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130991487 |
| 原始查询 | LOC130991487 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130991487 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057771727.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057771727.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057771727.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057771727.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057771727.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:1888072 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C58,C78 |
Chr7:1888079 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B13,C26,C39,C45 |
Chr7:1888165 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B10,B16,B21,C87 |
Chr7:1888230 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B15 |
Chr7:1888533 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B138,C32,C82 |
Chr7:1888596 |
A |
AG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 23 | A18,A9,B105,B115,B135,B136,B16,B22,B25,B41,B67,B74,B77,B80,B86,B9,C16,C4,C49,C53,C58,C63,C78 |
Chr7:1888626 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C15 |
Chr7:1888660 |
GC |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 4 | B131,C11,C39,C69 |
Chr7:1888660 |
GC |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 4 | B131,C11,C39,C69 |
Chr7:1888664 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C14,C24,C45 |
Chr7:1888670 |
T |
TCA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 4 | B107,B54,B81,B82 |
Chr7:1888670 |
T |
TCA |
2bp_insertion | CDS_variant | 4 | B107,B54,B81,B82 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。