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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000300`

染色体: Chr07 坐标: 1976231-1980056 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000300`
名称	SmilChr07G000300
描述	amine oxidase [copper-containing] alpha 2, peroxisomal-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	1976231 - 1980056 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991493`
GeneID	`130991493`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991493`
原始查询	`LOC130991493`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	amine oxidase [copper-containing] alpha 2, peroxisomal-like
产物	amine oxidase [copper-containing] alpha 2%2C peroxisomal-like
Arabidopsis	`AT1G31690` (AT1G31690) Copper amine oxidase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840056] identity=53.5; qcov=0.98; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0338200` (OsDAO1) - identity=50.1; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005507 (copper ion binding); GO:0008131 (primary methylamine oxidase activity); GO:0009308 (amine metabolic process); GO:0048038 (quinone binding)
KEGG	-
Pfam	PF01179 (Cu_amine_oxid); PF02727 (Cu_amine_oxidN2); PF02728 (Cu_amine_oxidN3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991493

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057771731.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057771731.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057771731.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771731.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771731.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:1976306`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B19,B2,C35
`Chr7:1976306`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B19,B2,C35
`Chr7:1976320`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	A6,B125
`Chr7:1976320`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	A6,B125
`Chr7:1976326`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B44,C74,D9
`Chr7:1976481`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B29
`Chr7:1976546`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C33,C46
`Chr7:1976555`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr7:1976572`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:1976659`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr7:1976680`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr7:1976689`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,C55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771731.1

650 aa

325

650

Cu_amine_oxidN2

Cu_amine_oxidN3

Cu_amine_oxid

PF02727 Cu_amine_oxidN2 29-112 aa PF02728 Cu_amine_oxidN3 127-226 aa PF01179 Cu_amine_oxid 247-648 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771731.1`	Pfam	`PF02727`	Cu_amine_oxidN2	Domain	29	112	2.7e-18	66.7	Copper amine oxidase, N2 domain
`XP_057771731.1`	Pfam	`PF02728`	Cu_amine_oxidN3	Domain	127	226	2.8e-20	73.2	Copper amine oxidase, N3 domain
`XP_057771731.1`	Pfam	`PF01179`	Cu_amine_oxid	Domain	247	648	2.7e-128	428.9	Copper amine oxidase, enzyme domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915748.1
TCATAACACACAAAAGAAATATTTGTGCTTGGCAATCATACCAAAAAAAAAATGCTTCCATCACTAAAAAATATCATTCTCTTCATCATCTTCTTCTTCCAAGCTCTAACCGCCATTTCACACCAAAATCATCCTCACCCCTTAGACTCCCTCACTCCATCGGAGCTCAATCAAGTTGGACTCATCGTCAGCGCCCATTTCTCGAACACGAACCGCAACGTGAGCTTCCACTACGTCGGCCTAGACGAGCCGCACAAGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991493
ATGCTTCCATCACTAAAAAATATCATTCTCTTCATCATCTTCTTCTTCCAAGCTCTAACCGCCATTTCACACCAAAATCATCCTCACCCCTTAGACTCCCTCACTCCATCGGAGCTCAATCAAGTTGGACTCATCGTCAGCGCCCATTTCTCGAACACGAACCGCAACGTGAGCTTCCACTACGTCGGCCTAGACGAGCCGCACAAGTCGGAGGTCCTAAGTTGGCGCTCCGATCCCGCCCGGCTCCCGCGTCGCAGAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771731.1
MLPSLKNIILFIIFFFQALTAISHQNHPHPLDSLTPSELNQVGLIVSAHFSNTNRNVSFHYVGLDEPHKSEVLSWRSDPARLPRRRAFVMARIDGGSHEIIVDLLRKSVVSDRLHRGRGYPLLNIEEQDAANKLPASYAPFIASVAKRGLKLEEVVCTSYTVGWFGEERSRRMIKLLCYYMDGTVNIYMRPIEGISVDVDLDRMAIVGYHDRGVVPVPKAQGTDYTGGHSSSMGSHALPKHGVGFTLDGQVLRWGLWEMH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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