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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000313`

染色体: Chr07 坐标: 2098035-2100025 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000313`
名称	SmilChr07G000313
描述	mavicyanin-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	2098035 - 2100025 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991508`
GeneID	`130991508`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991508`
原始查询	`LOC130991508`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mavicyanin-like
产物	mavicyanin-like
Arabidopsis	`AT5G26330` (AT5G26330) Cupredoxin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832702] identity=60.5; qcov=0.908; evalue=1.55e-61; confidence=high
Rice	`Os03g0807500` (OsSCL1) - identity=53.6; qcov=0.723; evalue=4.44e-45; confidence=medium
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0009055 (electron transfer activity)
KEGG	-
Pfam	PF02298 (Cu_bind_like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991508

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057771748.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771748.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771748.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771748.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771748.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:2098471`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B12,C45
`Chr7:2099583`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr7:2099627`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr7:2099634`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr7:2099742`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B14,C13,C28,C51,D4
`Chr7:2099746`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A25,B11,B70
`Chr7:2099748`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr7:2099750`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr7:2099796`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B14,C13,C28,C51,D4
`Chr7:2099820`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C25
`Chr7:2099820`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C25

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771748.1

173 aa

173

Cu_bind_like

PF02298 Cu_bind_like 32-115 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771748.1`	Pfam	`PF02298`	Cu_bind_like	Domain	32	115	2.2e-30	105.2	Plastocyanin-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915765.1
TTTCACTACTAAATTAGTTTAATATCAGCTATACTTTCCCAATATTTCCGCCATTTTTATCACACAAAAAGTAAAGAATTTAATATGTGAAAAGGGCTTCATGTTCGAGTTGAGCACTTTTTCACCCAAACTCTTCAAACACGGCTGTCATCAACACATCATCATCATTTTCATAATCATCAAAAGGGTCCATTTTGAAAGCTCCCAAACCTCCATATACTACCCTGAAACAAAGTGTTGTAGAGAGAGTTTGTGTGTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991508
ATGGCAATGGCAGCAGCAGGTGTGTGTTTGATAGTATTAGGTTTGTTAGAAGTGTCAAAAGGAGCTGTTTATAAAGTGGGAGATTCTGCAGGCTGGACTACCATTGGCAATGTCGATTACAAGCTCTGGTCTGCAACAAAAACCTTTCAACTTGGAGATACTATTGTGTTCGAGTACAACCCGCAGTTCCACAACGTGATGCAAGTGATCCACTCGGAGTACAAGGCGTGCAACGCGTCGTCCCCTATCTCGACTCACAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771748.1
MAMAAAGVCLIVLGLLEVSKGAVYKVGDSAGWTTIGNVDYKLWSATKTFQLGDTIVFEYNPQFHNVMQVIHSEYKACNASSPISTHTTGNDSLTIDTHGHHFFVCGVPGHCQSGQKVDINVLRSPSPSSGIPSPPLPAATVPSPSPSAAPPSLKLGCLPLTFLLFYLFYYPSA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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