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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000325`

染色体: Chr07 坐标: 2199934-2201268 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000325`
名称	SmilChr07G000325
描述	protein FANTASTIC FOUR 2
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	2199934 - 2201268 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991521`
GeneID	`130991521`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991521`
原始查询	`LOC130991521`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FANTASTIC FOUR 2
产物	protein FANTASTIC FOUR 2
Arabidopsis	`AT5G19260` (FAF3) FANTASTIC four-like protein (DUF3049) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832046] identity=39.3; qcov=0.421; evalue=3.04e-15; confidence=low
Rice	`Os03g0705800` - identity=32.5; qcov=0.648; evalue=2.17e-11; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF11250 (FAF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991521

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771765.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057771765.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057771765.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057771765.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771765.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:2200189`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64
`Chr7:2200217`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr7:2200222`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr7:2200628`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C41
`Chr7:2200645`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B6,B75
`Chr7:2200658`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,C17
`Chr7:2200670`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr7:2200688`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C33,C46,C82
`Chr7:2200718`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B122,B15
`Chr7:2200778`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B122,B139
`Chr7:2200793`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr7:2200954`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C33,C46,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771765.1

290 aa

145

290

FAF

PF11250 FAF 155-207 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771765.1`	Pfam	`PF11250`	FAF	Family	155	207	2.1e-17	63.7	Fantastic Four meristem regulator

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915782.1
TACAAATTGGCCCCCATCCCTCGCTTATCCCTCGTCCAATCTTCTCTACTTCACCTCTCTCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTACAAACTAAAACTTCACCATAAAATTTCAAGAAAACAAACCTAGTTCATCATCCACAACACTATAAATTTCAACTCTTTTCTCTCACTACAAAACCAACATGTCGACTATAATCTGCCAGAATCTCATCTCCTGCATCGAGCCACAGCTCGCCGAGACCACCACCACCCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991521
ATGTCGACTATAATCTGCCAGAATCTCATCTCCTGCATCGAGCCACAGCTCGCCGAGACCACCACCACCCTAAAGCTCAGAGTCGCGGCGGCGCCGCCTCCCGCCGCCTTGGAGCCGTGCAGAAGGCTCGCCGCCGGCGATCACCTCGAGCTCGGAAGCTGGGGTTTTCTCCAAAACAATCTTCAAGAATCGTCATCACCCATGAATAAAGATTGCTCCTACACACACCCTTTATCCAAGAACTCGAAATTGAGCCCTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771765.1
MSTIICQNLISCIEPQLAETTTTLKLRVAAAPPPAALEPCRRLAAGDHLELGSWGFLQNNLQESSSPMNKDCSYTHPLSKNSKLSPKSLELCTENLGSESGSDTFSDCSSIFSASPPLSPTSSSGDDHRAFALDDCRQKMRTSPTGDKYCRKIKNFPPPLTTMSGASSLQVRRRSDGGRLIIDAVEGPFRNSYLHAERSDGRLKLCFTTAAAAASGGGEEESDEAAECGAAEGEIEEPRIGFESEKEELDGEMNLLEKFQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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