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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000332`

染色体: Chr07 坐标: 2251040-2253894 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000332`
名称	SmilChr07G000332
描述	3-dehydrosphinganine reductase TSC10A
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	2251040 - 2253894 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991528`
GeneID	`130991528`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991528`
原始查询	`LOC130991528`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	3-dehydrosphinganine reductase TSC10A
产物	3-dehydrosphinganine reductase TSC10A
Arabidopsis	`AT3G06060` (TSC10A) NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819779] identity=63.4; qcov=0.969; evalue=8.5e-145; confidence=high
Rice	`Os02g0701900` - identity=69.4; qcov=0.957; evalue=6.57e-161; confidence=high
GO	GO:0005789 (endoplasmic reticulum membrane); GO:0006666 (3-keto-sphinganine metabolic process); GO:0030148 (sphingolipid biosynthetic process); GO:0047560 (3-dehydrosphinganine reductase activity)
KEGG	smil00600 (Sphingolipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04382 (Cornified envelope formation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00106 (adh_short); PF01370 (Epimerase); PF08659 (KR); PF13561 (adh_short_C2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991528

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057771780.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057771780.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771780.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771780.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771780.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:2251447`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B77,C54
`Chr7:2251465`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr7:2251483`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:2252441`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr7:2253096`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr7:2253149`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,B35
`Chr7:2253202`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr7:2253307`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr7:2253316`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr7:2253525`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B24,C33,C46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771780.1

324 aa

162

324

adh_short

Epimerase

adh_short_C2

PF00106 adh_short 40-231 aa PF01370 Epimerase 41-155 aa PF08659 KR 41-203 aa PF13561 adh_short_C2 48-243 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771780.1`	Pfam	`PF00106`	adh_short	Domain	40	231	3.7e-48	164.3	short chain dehydrogenase
`XP_057771780.1`	Pfam	`PF01370`	Epimerase	Family	41	155	1.9e-06	28.2	NAD dependent epimerase/dehydratase family
`XP_057771780.1`	Pfam	`PF08659`	KR	Family	41	203	2.9e-13	50.8	KR domain
`XP_057771780.1`	Pfam	`PF13561`	adh_short_C2	Domain	48	243	2.9e-31	109.6	Enoyl-(Acyl carrier protein) reductase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915797.1
AAATCAAAATTACATTGATTAATCCGACAATTACGCCTTAAATTGGATTCTCTTATCTTTCATCTTCACATCCAAACAAAAAACAGAGCACACTAAAAAAGATTTCTTGCTCACTCCACTCAAAGCTTTTCCAAATTGCTCGATTCAATCAAACTACACCATTTCAAAATTCGCACAATCAAACAACAAATTAATCTCGATTGCTTCTCAATTTCTCCCCAAACCCCATTTGATAATCGATACATCACCGTTACTGTAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991528
ATGGCGGAGGTCTACTTCTCCTTCTTCTCTCTCCTCCTCCTCATCCCACTCTCTCTCCTCCTCATCCTCTACCTCATCGTCCGCCCCAAGGCCGTCCGCGTCCCGATCAAGAACCGCCACGTGTTCATCACCGGCGGCTCCAGCGGCATCGGCCTAGCCCTAGCGCGCCTCTGCGCCCAAAGCGGCGCCGACGTCACACTCCTCGCGCGCAACGCCGCCCGCCTGGAGGAGGCCCAGCAGTCGATCAAGCTCGCCACGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771780.1
MAEVYFSFFSLLLLIPLSLLLILYLIVRPKAVRVPIKNRHVFITGGSSGIGLALARLCAQSGADVTLLARNAARLEEAQQSIKLATGRDVRVFSADVRDYDAVKRAVEEAGPIDVLVCNHGVYVPQELEEQDLEEIKFMIDVNLTGTFHLIKAALPGMKRNRAEKGPGSIAIMSSQAGQVGIYGYTAYSASKFGLKGLAEALQHEVIADNIHLSLIFPPDTETPGFAEETKRRPQLTSIIAASSGAMKAEEVAEKSLKGI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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