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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000348`

染色体: Chr07 坐标: 2357758-2363419 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000348`
名称	SmilChr07G000348
描述	choline transporter protein 1
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	2357758 - 2363419 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991549`
GeneID	`130991549`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991549`
原始查询	`LOC130991549`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	choline transporter protein 1
产物	choline transporter protein 1
Arabidopsis	`AT3G15380` (AT3G15380) Plasma-membrane choline transporter family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820777] identity=73.1; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0681400` - identity=71.9; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0022857 (transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF04515 (Choline_transpo)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991549

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057771811.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	1.00000	`XP_057771811.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771811.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771811.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771811.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:2358265`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr7:2358347`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,C82
`Chr7:2358410`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6
`Chr7:2358959`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,C50
`Chr7:2358968`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr7:2359172`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B62,B91
`Chr7:2359185`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B62,B91
`Chr7:2359244`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,C50
`Chr7:2359292`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15
`Chr7:2359447`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B129,C50
`Chr7:2359450`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B62,B91
`Chr7:2359456`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B62,B91

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771811.1

716 aa

358

716

Choline_transpo

PF04515 Choline_transpo 331-642 aa

XP_057771812.1

702 aa

351

702

Choline_transpo

PF04515 Choline_transpo 331-673 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771811.1`	Pfam	`PF04515`	Choline_transpo	Family	331	642	8.6e-75	252.7	Plasma-membrane choline transporter
`XP_057771812.1`	Pfam	`PF04515`	Choline_transpo	Family	331	673	1.1e-87	295.0	Plasma-membrane choline transporter

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915829.1
ATAATAATCCATAAATTAGCAAGGAAAAGATATTCCCGCACTGTCGTCCCTTTCACACTCTCCTTCCCATCCCTCTCTGCTCCCAAATCTCGCAGAACCCTTCACTCACTCTTCTCTTCCTTCTCCACTTCCGCCGCCACCGCCGCCACATCCACCGTCGCTTGATTTCACGAAACCCCACATTTCCAAACCCAGATTCGACAAAAACCTCTGAAACCAACACTCATCTTCTAGCTCAGAAACCACAACAAACCCCTGCT...

XM_057915828.1
AAGGAAAAGATATTCCCGCACTGTCGTCCCTTTCACACTCTCCTTCCCATCCCTCTCTGCTCCCAAATCTCGCAGAACCCTTCACTCACTCTTCTCTTCCTTCTCCACTTCCGCCGCCACCGCCGCCACATCCACCGTCGCTTGATTTCACGAAACCCCACATTTCCAAACCCAGATTCGACAAAAACCTCTGAAACCAACACTCATCTTCTAGCTCAGAAACCACAACAAACCCCTGCTTCAAACCGGCTCCCATTCTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130991549
ATGAGAGGGCCGCTGGGACCAGTGATAGGGAAGTATCCATCATCGAGTGATGCTAATGGTGGAATGGGGAATGGAAACAATGATATCATCAAACACAACAGGAAATGCAGAGATTTGGTGTTTCTTGTCATATTCATTGCCTTTTGGATTGCAATGATTGTTAACTCCAGCTTTGCTTTCAACCAAGGAAACCCATTGAGGCTAAACTACGGGCTGGACTATAAAGGGAATGTTTGTGGCGATAGACATGGTGATCGGGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057771811.1
MRGPLGPVIGKYPSSSDANGGMGNGNNDIIKHNRKCRDLVFLVIFIAFWIAMIVNSSFAFNQGNPLRLNYGLDYKGNVCGDRHGDRDLREVELRYWLNPNQVYQSGVKDSKFELSNARSICLMDCPIPSEDSLNWVCDYPEGDIRISLDDWIDRNYDYFADLTPELRNTSLQLQGPCYPVIFPSVNVFWTCQFIARASNVSLNHWEQMNGVKIIEDIAIDRAIHKSINSRSSVLKRYVADVGKSWPVLLVCGGFLPLFLS...

XP_057771812.1
MRGPLGPVIGKYPSSSDANGGMGNGNNDIIKHNRKCRDLVFLVIFIAFWIAMIVNSSFAFNQGNPLRLNYGLDYKGNVCGDRHGDRDLREVELRYWLNPNQVYQSGVKDSKFELSNARSICLMDCPIPSEDSLNWVCDYPEGDIRISLDDWIDRNYDYFADLTPELRNTSLQLQGPCYPVIFPSVNVFWTCQFIARASNVSLNHWEQMNGVKIIEDIAIDRAIHKSINSRSSVLKRYVADVGKSWPVLLVCGGFLPLFLS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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