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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000357`

染色体: Chr07 坐标: 2444963-2446952 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000357`
名称	SmilChr07G000357
描述	adenylate isopentenyltransferase 5, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	2444963 - 2446952 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991557`
GeneID	`130991557`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991557`
原始查询	`LOC130991557`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	adenylate isopentenyltransferase 5, chloroplastic-like
产物	adenylate isopentenyltransferase 5%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT5G19040` (IPT5) isopentenyltransferase 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832023] identity=60.5; qcov=0.901; evalue=3.66e-120; confidence=high
Rice	`Os03g0810100` (OsIPT4) - identity=57.4; qcov=0.84; evalue=1.52e-95; confidence=high
GO	GO:0005739 (mitochondrion); GO:0006400 (tRNA modification); GO:0009691 (cytokinin biosynthetic process); GO:0052381 (tRNA dimethylallyltransferase activity)
KEGG	smil00908 (Zeatin biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01715 (IPPT); PF01745 (IPT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991557

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057771825.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057771825.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771825.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771825.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771825.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:2445458`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr7:2445578`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr7:2445650`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,B47
`Chr7:2445692`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B113,B70,B87
`Chr7:2445737`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,C42
`Chr7:2445758`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31
`Chr7:2445834`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B31,B48,B91,B98
`Chr7:2445869`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr7:2445880`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr7:2445881`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr7:2445891`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,B64
`Chr7:2445902`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771825.1

332 aa

166

332

IPT

IPPT

PF01745 IPT 36-160 aa PF01715 IPPT 70-143 aa PF01715 IPPT 147-245 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771825.1`	Pfam	`PF01745`	IPT	Domain	36	160	1.5e-08	35.0	Isopentenyl transferase
`XP_057771825.1`	Pfam	`PF01715`	IPPT	Domain	70	143	5.3e-38	131.8	IPP transferase
`XP_057771825.1`	Pfam	`PF01715`	IPPT	Domain	147	245	5.3e-38	131.8	IPP transferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915842.1
GACTCGTTTCTATGCATGGCTTCAACACTTTCCCCTCTCCTTACTATAAATACATCTCCACTCAAACCTATTCTGCACATTTAATCTAAGCTTCAAACAACAAAACATAACTACACTTCTCTCTTCTCATCTTCACTCCCTTCCTTTCCCCGCTTCTCTTTCACTCCATCAACACACGTCATTGCAGGTTCGCCGCGTACATATAAAAAGGTGTGATTAATTGATTGACGACATATATAAGCATGAATATTTCATTCTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991557
ATGAATATTTCATTCTCCGCCGCCTGCAAGCAAACGCAGCCGCCGCCGATGGTGAACTTCCCCGGCGGCCTGCTGAACCTCATTCCGCGGCAGCGGCGCAAGGAGAAGGTGGTGGTGGTAATGGGCGCGACGGGGACGGGGAAATCGCGGCTGTCGATCGAGCTCGCCACGCGCTTCGGCGCGGAGGTGATCAACTCCGACAAAATGCAAGTCTACAAGGGGCTCGACATCGTCACCAACAAGGTCAACGAGGAGGAATG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771825.1
MNISFSAACKQTQPPPMVNFPGGLLNLIPRQRRKEKVVVVMGATGTGKSRLSIELATRFGAEVINSDKMQVYKGLDIVTNKVNEEECGGVPHHLLGFVDPEADFWAHDFVYHASAAADDIAKRGRMPIIAGGSNSFIKALVNDDHHFRSRYDCCFLWVDVAMPLLHSFVSKRVDQMVDSGLVAEAREFFDPAGDYSRGIRRAIGVPELHEYFRSQGGGAARAKLLDAGIDQIKSNTRTLACRQLQNIMRLAEHLEWRMHR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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