当前解析结果
SmilChr07G000381| 统一新 Gene ID | SmilChr07G000381 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G000381 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G000381 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 2566741 - 2572125 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130991582 |
|---|---|
| GeneID | 130991582 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130991582 |
| 原始查询 | LOC130991582 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | Mo25 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832012]; symbol=AT5G18940; hit=AT5G18940; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | Mo25 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832012]; symbol=AT5G18940; hit=AT5G18940; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT5G18940 (AT5G18940)Mo25 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832012] identity=75.2; qcov=0.936; evalue=0; confidence=high |
| Rice | Os07g0647100 (OJ1316_A04.107)- identity=63.4; qcov=0.983; evalue=2.58e-159; confidence=high |
| GO | GO:0035556 (intracellular signal transduction); GO:0043539 (protein serine/threonine kinase activator activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF08569 (Mo25) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130991582 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057771854.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057771854.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057771854.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057771854.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057771854.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:2569596 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B20,B42,B43,C13 |
Chr7:2569813 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C42 |
Chr7:2570021 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B137,B139,B27,C4,C69 |
Chr7:2570038 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C58,C85 |
Chr7:2570484 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B122 |
Chr7:2570790 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B100 |
Chr7:2571782 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A11 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057771854.1PF08569
Mo25 5-336 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057771854.1 |
Pfam | PF08569 |
Mo25 | Repeat | 5 | 336 | 6.4e-122 | 407.7 | Mo25-like |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。