当前解析结果
SmilChr07G000391| 统一新 Gene ID | SmilChr07G000391 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G000391 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G000391 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 2635258 - 2636497 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130991589 |
|---|---|
| GeneID | 130991589 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130991589 |
| 原始查询 | LOC130991589 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130991589 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057771863.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057771863.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057771863.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057771863.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057771863.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:2635552 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B20,B7,C53,C72 |
Chr7:2635554 |
C |
CA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 18 | A10,A22,A3,B138,B22,B45,B5,B67,B71,B72,C27,C31,C36,C41,C47,C75,C87,D10 |
Chr7:2635557 |
T |
TGC |
2bp_insertion | frameshift_variant | 4 | A25,B76,B97,C15 |
Chr7:2635557 |
T |
TGC |
2bp_insertion | CDS_variant | 4 | A25,B76,B97,C15 |
Chr7:2635584 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B20,B7,C53,C72 |
Chr7:2635601 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C65 |
Chr7:2635627 |
ATG |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 22 | B100,B102,B11,B111,B12,B15,B17,B20,B35,B55,B59,B6,B83,C10,C18,C20,C57,C65,C67,C69,C7,C84 |
Chr7:2635629 |
GAC |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 37 | A10,A19,A22,A7,A9,B106,B107,B113,B125,B138,B139,B4,B43,B45,B5,B56,B62,B65,B67,B68,B72,B85,B91,B94,C11,C16,C2,C31,C33,C36,C48,C49,C53,C75,C8,C87,D10 |
Chr7:2635682 |
C |
CT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 35 | A11,A14,A18,A3,A5,A9,B106,B107,B111,B113,B117,B135,B138,B139,B20,B26,B35,B43,B51,B69,B76,B84,B86,B94,C14,C28,C31,C45,C48,C49,C53,C7,C75,C81,C82 |
Chr7:2635684 |
CG |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 33 | A11,A14,A18,A3,A5,A9,B106,B107,B111,B113,B117,B135,B138,B139,B20,B26,B35,B51,B69,B76,B86,B94,C14,C31,C45,C48,C49,C53,C67,C7,C75,C81,C82 |
Chr7:2635716 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A14,B117,C45 |
Chr7:2635733 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B28,C27 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。