当前解析结果
SmilChr07G000405| 统一新 Gene ID | SmilChr07G000405 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G000405 |
| 描述 | histidine-containing phosphotransfer protein 1-like |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 2799738 - 2801654 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130991601 |
|---|---|
| GeneID | 130991601 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130991601 |
| 原始查询 | LOC130991601 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | histidine-containing phosphotransfer protein 1-like |
| 产物 | histidine-containing phosphotransfer protein 1-like |
| Arabidopsis | AT3G21510 (AHP1)histidine-containing phosphotransmitter 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821705] identity=71.4; qcov=0.961; evalue=1.1e-69; confidence=high |
| Rice | Os08g0557700 (AHP1)- identity=54.7; qcov=0.837; evalue=6.03e-46; confidence=medium |
| GO | GO:0000160 (phosphorelay signal transduction system); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0009736 (cytokinin-activated signaling pathway); GO:0009927 (histidine phosphotransfer kinase activity); GO:0016310 (phosphorylation); GO:0043424 (protein histidine kinase binding) |
| KEGG | smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)) |
| Pfam | PF01627 (Hpt) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130991601 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057771881.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057771881.1 |
| 3 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057771881.1 |
| 4 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057771881.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057771881.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:2800059 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A24,B77,C5,C61 |
Chr7:2801204 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057771881.1PF01627
Hpt 43-123 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057771881.1 |
Pfam | PF01627 |
Hpt | Domain | 43 | 123 | 1.2e-15 | 58.2 | Hpt domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。