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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000409`

染色体: Chr07 坐标: 2832635-2833627 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000409`
名称	SmilChr07G000409
描述	protein DMP2-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	2832635 - 2833627 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991606`
GeneID	`130991606`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991606`
原始查询	`LOC130991606`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein DMP2-like
产物	protein DMP2-like
Arabidopsis	`AT3G21550` (DMP2) transmembrane protein, putative (DUF679 domain membrane protein 2) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821709] identity=63.5; qcov=0.942; evalue=1.45e-78; confidence=high
Rice	`Os03g0370400` - identity=47.6; qcov=0.979; evalue=1.1e-58; confidence=high
GO	GO:0010256 (endomembrane system organization)
KEGG	-
Pfam	PF05078 (DUF679)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991606

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057771886.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	0.80000	`XP_057771886.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057771886.1`
4	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.60000	`XP_057771886.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771886.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:2833014`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A21,B124,C5,C61,C78,D5
`Chr7:2833080`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B17,B50,C30,D3
`Chr7:2833178`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B11
`Chr7:2833178`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B11
`Chr7:2833219`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr7:2833268`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B100,C25,C50,C9
`Chr7:2833323`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771886.1

189 aa

189

DUF679

PF05078 DUF679 21-180 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771886.1`	Pfam	`PF05078`	DUF679	Family	21	180	2.1e-66	223.6	Protein of unknown function (DUF679)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915903.1
AAAATGTTTTTCAAACATATATTGGTGAAATTTACATAATCTTGAAGCATTGATCACACTTCCCAAGAGTAAAGGCAAAACATACCCAAAAAAAATCCCTACTTGTTGATTAAGCTCATCACATCTTACGTAGAAGCAATTCCCACAAAACACACACACCCACACACTAAACACTTCTTATATCAACCCCATTCAACAAGCCAAAAACACACACAAAAAACACTTGAACACCAAAACCACACACACAACACACACACCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991606
ATGTCATCCAAACCTAGCAACCCACCACCACCAAGAACCACCGCACAAGCCACCCTCGCCGGCATCGGCAACCTCATCAAGCTCCTCCCGACGGGCACCGTCTTCGCCTTCCAATTCCTCAACCCCGTCTTCACCAACGACGGCCAATGCCACCCGATCCACAAGTACCTCGCGAGCTTCCTCATCGCGGCCTGTGGCGCCTCCTGCTGCTTCGCCTCCTTCACCGACAGCTACACGGACAACGAGGGCAACGTGCATTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771886.1
MSSKPSNPPPPRTTAQATLAGIGNLIKLLPTGTVFAFQFLNPVFTNDGQCHPIHKYLASFLIAACGASCCFASFTDSYTDNEGNVHYGVATTKGLWPSPSPSSAPDLSSYKLRFGDFVHAFFSLVVFSVVSLLDPNTVKCFYPSFESAQKALLMAMPPVIGAISGAVFVMFPNTRHGIGYPCSQASSQA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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