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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000415`

染色体: Chr07 坐标: 2863061-2864556 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000415`
名称	SmilChr07G000415
描述	peptide methionine sulfoxide reductase B5-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	2863061 - 2864556 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991610`
GeneID	`130991610`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991610`
原始查询	`LOC130991610`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peptide methionine sulfoxide reductase B5-like
产物	peptide methionine sulfoxide reductase B5-like
Arabidopsis	`AT4G04830` (MSRB5) methionine sulfoxide reductase B5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825820] identity=81; qcov=0.926; evalue=3.54e-75; confidence=high
Rice	`Os03g0360700` (OsMSR1) - identity=80; qcov=0.919; evalue=3.86e-75; confidence=high
GO	GO:0006979 (response to oxidative stress); GO:0030091 (protein repair); GO:0033743 (peptide-methionine (R)-S-oxide reductase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01641 (SelR)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991610

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057771897.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057771897.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057771896.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771896.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771896.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:2863169`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	25	A13,A18,A25,A4,B114,B118,B119,B126,B130,B137,B29,B31,B34,B5,B60,B84,B88,B99,C12,C36,C40,C45,C48,C6,C87
`Chr7:2863243`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr7:2863261`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,A5,C15,C58
`Chr7:2863288`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B131,B82,C8
`Chr7:2863295`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B95
`Chr7:2863295`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr7:2863347`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B138
`Chr7:2863357`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B138
`Chr7:2863363`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr7:2863379`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B138
`Chr7:2863419`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:2863423`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771896.1

189 aa

189

SelR

PF01641 SelR 15-80 aa

XP_057771897.1

136 aa

136

SelR

PF01641 SelR 15-127 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771896.1`	Pfam	`PF01641`	SelR	Domain	15	80	2.8e-23	82.8	SelR domain
`XP_057771897.1`	Pfam	`PF01641`	SelR	Domain	15	127	1.3e-43	148.4	SelR domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915914.1
GGATATTATTAAACATGTTTTTGCTCACGTTTGGAAAATTAGCATCTGAGTCGCGAAGCCGTCCACATTCACTTTCTCACTCATCAAATTCAAGGCGAGAAACTTCTCACTATAAATAGCATCCCACAGCCACTGCTCCTGCTCCAAACAGATCAATCAAAATACTGAAAAAAACGAAAAGAAAAGGAATTTTGTAAGAGAAATTTAATGGGTTCAGTGCAGAAAGCAGAGGAGGAATGGCGAGCCATTCTCACTCCTCA...

XM_057915913.1
GGATATTATTAAACATGTTTTTGCTCACGTTTGGAAAATTAGCATCTGAGTCGCGAAGCCGTCCACATTCACTTTCTCACTCATCAAATTCAAGGCGAGAAACTTCTCACTATAAATAGCATCCCACAGCCACTGCTCCTGCTCCAAACAGATCAATCAAAATACTGAAAAAAACGAAAAGAAAAGGAATTTTGTAAGAGAAATTTAATGGGTTCAGTGCAGAAAGCAGAGGAGGAATGGCGAGCCATTCTCACTCCTCA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130991610
ATGGGTTCAGTGCAGAAAGCAGAGGAGGAATGGCGAGCCATTCTCACTCCTCAGCAGTTTCATATTCTCCGCCAAAAGGGAACCGAGCCGAGAGGGACGGGGCACTACGACAAGTTCTACGAGGAAGGGATATACAATTGTGCCGGCTGTGGAACGCCGCTCTACAAATCAACGACCAAATTTGACTCCGGGTGCGGTTGGCCCGCCTTCTTTGAAGGTGTGCCGGGTGCCATCACCCGTTCGGTTGGTATCCCAACTTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057771896.1
MGSVQKAEEEWRAILTPQQFHILRQKGTEPRGTGHYDKFYEEGIYNCAGCGTPLYKSTTKFDSGCGWPAFFEGVPGAITRSVGIPTFFMTMSHFVSHFVKFMFVVCFSPTLMAGGRRSLAPPVVATWGMSSRERGTRCRQTRGIALTASRSSSWRPELRKPLHSVVLDGVESLACDFLMFSCEFVMDFS

XP_057771897.1
MGSVQKAEEEWRAILTPQQFHILRQKGTEPRGTGHYDKFYEEGIYNCAGCGTPLYKSTTKFDSGCGWPAFFEGVPGAITRSPDPDGRRTEITCTACGGHLGHVFKGEGHPVPTDERHCVNSVSIKFVAAGAPEATP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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