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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000420`

染色体: Chr07 坐标: 2904489-2909043 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000420`
名称	SmilChr07G000420
描述	AP-5 complex subunit mu
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	2904489 - 2909043 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991615`
GeneID	`130991615`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991615`
原始查询	`LOC130991615`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AP-5 complex subunit mu
产物	AP-5 complex subunit mu
Arabidopsis	`AT2G20790` (AT2G20790) clathrin adaptor complexes medium subunit family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816608] identity=66.4; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0528300` - identity=60.8; qcov=0.209; evalue=3.78e-37; confidence=weak
GO	GO:0005764 (lysosome); GO:0005770 (late endosome); GO:0005829 (cytosol); GO:0016197 (endosomal transport); GO:0030119 (AP-type membrane coat adaptor complex)
KEGG	smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00928 (Adap_comp_sub)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991615

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057771906.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	1.00000	`XP_057771906.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057771906.1`
4	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.80000	`XP_057771907.1`
5	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057771906.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:2905727`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B130,B84,C45,C50
`Chr7:2905814`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B130,B84,C45
`Chr7:2905967`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B78,C1
`Chr7:2906093`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B25,B85,C16,C51
`Chr7:2906312`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B53,B69,B88,C24
`Chr7:2906419`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B93,C2,C62
`Chr7:2906811`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr7:2907675`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,C48
`Chr7:2907699`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B51
`Chr7:2907817`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:2908636`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,C4
`Chr7:2908751`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B124,C78,C85,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771906.1

620 aa

310

620

Adap_comp_sub

PF00928 Adap_comp_sub 298-578 aa

XP_057771907.1

573 aa

286

573

Adap_comp_sub

PF00928 Adap_comp_sub 251-531 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771906.1`	Pfam	`PF00928`	Adap_comp_sub	Family	298	578	1.2e-28	100.9	Adaptor complexes medium subunit family
`XP_057771907.1`	Pfam	`PF00928`	Adap_comp_sub	Family	251	531	1e-28	101.1	Adaptor complexes medium subunit family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915923.1
TGAAAAGAAAATTACAATCAATCAAAATATCGCATCTTCTCGAATTAGTTCAACTCTCCCTCCTCGAATCTCACTTATCGATTCACAACAAGTAGGGAGATGCTGTAAATATCGCAATCGGAAACGTCAAAATGCTAAGCGGTTGCTACATCAGAGCTCTGTGGATTCTGAACAATCAGGACTTTGTAATTTTCTCCAGGAAGTTTCCGGTGGTGGAAAAGCGGTGGCGCGTGGCTTGTGAGAAGGAAGACAGCGATGAT...

XM_057915924.1
AATATCGCATCTTCTCGAATTAGTTCAACTCTCCCTCCTCGAATCTCACTTATCGATTCACAACAAGTAGGGAGATGCTGTAAATATCGCAATCGGAAACGTCAAAATGCTAAGCGGTTGCTACATCAGAGCTCTGTGGATTCTGAACAATCAGGACTTTGTAATTTTCTCCAGTTTCCGGTGGTGGAAAAGCGGTGGCGCGTGGCTTGTGAGAAGGAAGACAGCGATGATTTCAAGTATCATATGTTGCCTAACGATTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130991615
ATGCTAAGCGGTTGCTACATCAGAGCTCTGTGGATTCTGAACAATCAGGACTTTGTAATTTTCTCCAGGAAGTTTCCGGTGGTGGAAAAGCGGTGGCGCGTGGCTTGTGAGAAGGAAGACAGCGATGATTTCAAGTATCATATGTTGCCTAACGATTCGGACGTCACTGCTGCTTTTAGCGAGCGTAAGAAGCGGGAGGGTTCAGCTCGAGGATTTGGCATACGTGTGAGCCAATCTGTTAAGGGATCAGATTCATGGGT...

LOC130991615
ATGTTGCCTAACGATTCGGACGTCACTGCTGCTTTTAGCGAGCGTAAGAAGCGGGAGGGTTCAGCTCGAGGATTTGGCATACGTGTGAGCCAATCTGTTAAGGGATCAGATTCATGGGTTGATGATCCAATTACTCGTCATGTGATAAGTTTATACATTAATAAAGAAGAAGGGGAGAATAATCTCCTGTGGCCCCTGGTTCTACATATAAAGGGACCCTATTCTATTCTTATATTGCCTTTGGTTGAACCTCGTCATTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057771906.1
MLSGCYIRALWILNNQDFVIFSRKFPVVEKRWRVACEKEDSDDFKYHMLPNDSDVTAAFSERKKREGSARGFGIRVSQSVKGSDSWVDDPITRHVISLYINKEEGENNLLWPLVLHIKGPYSILILPLVEPRHLKSYSRMCNTSDCGSVIGADESLSSLLLDLPSITGAFAVAQTIGDIVVGEAVEPEVVVAASPSVGGLLDTLTGSIGISSISARAKPVASPVAASTISGTAVTGAATSDAPKMGSRPLDKDVLRSFIS...

XP_057771907.1
MLPNDSDVTAAFSERKKREGSARGFGIRVSQSVKGSDSWVDDPITRHVISLYINKEEGENNLLWPLVLHIKGPYSILILPLVEPRHLKSYSRMCNTSDCGSVIGADESLSSLLLDLPSITGAFAVAQTIGDIVVGEAVEPEVVVAASPSVGGLLDTLTGSIGISSISARAKPVASPVAASTISGTAVTGAATSDAPKMGSRPLDKDVLRSFISSAMPFGTPLDLSYSNISAIKTTGFSSADVPPADRKQPAWKPYLYKGK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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