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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000423`

染色体: Chr07 坐标: 2949953-2951336 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000423`
名称	SmilChr07G000423
描述	putative F-box/FBD/LRR-repeat protein At5g56810
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	2949953 - 2951336 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991620`
GeneID	`130991620`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991620`
原始查询	`LOC130991620`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative F-box/FBD/LRR-repeat protein At5g56810
产物	putative F-box/FBD/LRR-repeat protein At5g56810
Arabidopsis	`AT1G13780` (AT1G13780) F-box/RNI-like/FBD-like domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837938] identity=26.5; qcov=0.628; evalue=3.12e-09; confidence=low
Rice	`Os04g0440300` (OsFbox211) - identity=31.2; qcov=0.175; evalue=1.58e-06; confidence=weak
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF07723 (LRR_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991620

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771911.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771911.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771911.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771911.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057771911.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:2949973`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C25,C27
`Chr7:2950029`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr7:2950141`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr7:2950161`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B138,B17,B50,B89,C30
`Chr7:2950223`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B119,B127,B4,C79,D3
`Chr7:2950229`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A25,B14,B22,B71,C17
`Chr7:2950246`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr7:2950251`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:2950271`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B119,B127,B4,C79,D3
`Chr7:2950292`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B124,C13,D5
`Chr7:2950504`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr7:2950505`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B68,B98,C45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771911.1

457 aa

228

457

LRR_2

PF07723 LRR_2 150-174 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771911.1`	Pfam	`PF07723`	LRR_2	Repeat	150	174	4.2e-05	24.7	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915928.1
GTGTCTTGAAATGGAAAAGAGAAAGAGCAATCGAATCGAAACCCCATTGCCGGAATCCATGATTCACCTCATACAGTCTTTCTTGAGTGCGAAAGAAGCTGCTCAAACCACTCTTCTCTGTAAATCATGGTACGACGCTTGGCTAACTCGTCCTGCTCTCGCCTTCAATCAACGCAACTTCAAAAATCAAGCATTGGAAGAGTTCTCAAAATTTGCAGTGAAGACCATGCGAAGGTATCAAGACTCGAACTTGAAGATAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991620
ATGGAAAAGAGAAAGAGCAATCGAATCGAAACCCCATTGCCGGAATCCATGATTCACCTCATACAGTCTTTCTTGAGTGCGAAAGAAGCTGCTCAAACCACTCTTCTCTGTAAATCATGGTACGACGCTTGGCTAACTCGTCCTGCTCTCGCCTTCAATCAACGCAACTTCAAAAATCAAGCATTGGAAGAGTTCTCAAAATTTGCAGTGAAGACCATGCGAAGGTATCAAGACTCGAACTTGAAGATAGAGAGTTTGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771911.1
MEKRKSNRIETPLPESMIHLIQSFLSAKEAAQTTLLCKSWYDAWLTRPALAFNQRNFKNQALEEFSKFAVKTMRRYQDSNLKIESLRLKMQGCTSSSERLARNLIMDAMKMGATDLKLEFFPTAYTLRSETLLRLSVSGCEIYGHVICPMLKALSLDRVLLKSEDMLADIISCCNLIEELSLSHSYICTNRCIGLSGKDVPELHKLKRLHLEAVRVDTFLFDLETRFPCLNDLSLVSCHGYGLQAIRVTSFSLQSISIVQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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