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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000440`

染色体: Chr07 坐标: 3070814-3073616 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000440`
名称	SmilChr07G000440
描述	superoxide dismutase [Cu-Zn]
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	3070814 - 3073616 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991631`
GeneID	`130991631`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991631`
原始查询	`LOC130991631`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	superoxide dismutase [Cu-Zn]
产物	superoxide dismutase [Cu-Zn]
Arabidopsis	`AT1G08830` (CSD1) copper/zinc superoxide dismutase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837405] identity=84.2; qcov=1; evalue=8.48e-90; confidence=high
Rice	`Os03g0351500` (SODCC1) - identity=84.2; qcov=1; evalue=4.39e-91; confidence=high
GO	GO:0004784 (superoxide dismutase activity); GO:0005507 (copper ion binding); GO:0019430 (removal of superoxide radicals)
KEGG	smil04146 (Peroxisome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00080 (Sod_Cu)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991631

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057771927.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057771927.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.60000	`XP_057771927.1`
4	Mitochondrion intermembrane space	Mitochondrion intermembrane space	0.40000	`XP_057771927.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771927.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:3071980`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr7:3072454`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B136,C62,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771927.1

152 aa

152

Sod_Cu

PF00080 Sod_Cu 14-148 aa

XP_057771928.1

152 aa

152

Sod_Cu

PF00080 Sod_Cu 14-148 aa

XP_057771929.1

152 aa

152

Sod_Cu

PF00080 Sod_Cu 14-148 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771927.1`	Pfam	`PF00080`	Sod_Cu	Domain	14	148	8.3e-53	179.1	Copper/zinc superoxide dismutase (SODC)
`XP_057771928.1`	Pfam	`PF00080`	Sod_Cu	Domain	14	148	8.3e-53	179.1	Copper/zinc superoxide dismutase (SODC)
`XP_057771929.1`	Pfam	`PF00080`	Sod_Cu	Domain	14	148	8.3e-53	179.1	Copper/zinc superoxide dismutase (SODC)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915946.1
ACACATTGGTCATTTATTGACTTACATATAAAATAAAGGACAGTATTAAAAATGAAAATAAATTGAAAATTATGGCCTTGACCTACCCTCTCTTTCATGTACACTGAATTTTAACTAGAATCTTCCATTTCAGTATTTCACTCTCGCTCTCTCTCTCCCTCTCCCTCAGCTCTATTACTTCAATCAGGGGTGCTCTGAGATCACATAAGTAGATAACAATGGTGAAGGCTGTCGTAGTTCTTAACAGCAGCGAGGGTGTG...

XM_057915944.1
AAAATGAAAATAAATTGAAAATTATGGCCTTGACCTACCCTCTCTTTCATGTACACTGAATTTTAACTAGAATCTTCCATTTCAGTATTTCACTCTCGCTCTCTCTCTCCCTCTCCCTCAGCTCTATTACTTCAATCAGGGGTGCTCTGAGGTAAAAATATTCGATACAAAAATTAGAGAAAGAATCTGCAGATCACATAAGTAGATAACAATGGTGAAGGCTGTCGTAGTTCTTAACAGCAGCGAGGGTGTGAGTGGCA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130991631
ATGGTGAAGGCTGTCGTAGTTCTTAACAGCAGCGAGGGTGTGAGTGGCACCGTCAGCTTCACTCAGGAGGGAGATGGTCCAACAACCGTGACTGGAAACGTTTCTGGTCTTAAGCCTGGACTCCATGGCTTTCACGTGCATGCCCTTGGTGACACCACCAATGGTTGCATGTCAACTGGACCTCACTTCAATCCTGCTGGCAAAGAGCATGGTGCTCCTGAAGATGATAATCGCCATGCTGGTGACCTTGGGAACATCAC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057771927.1
MVKAVVVLNSSEGVSGTVSFTQEGDGPTTVTGNVSGLKPGLHGFHVHALGDTTNGCMSTGPHFNPAGKEHGAPEDDNRHAGDLGNITVGEDGKASFTIVDKQIPLSGPHSIIGRAVVVHGDPDDLGKGGHELSKSTGNAGGRIACGIIGLQG

XP_057771928.1
MVKAVVVLNSSEGVSGTVSFTQEGDGPTTVTGNVSGLKPGLHGFHVHALGDTTNGCMSTGPHFNPAGKEHGAPEDDNRHAGDLGNITVGEDGKASFTIVDKQIPLSGPHSIIGRAVVVHGDPDDLGKGGHELSKSTGNAGGRIACGIIGLQG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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