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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003283`

染色体: Chr01 坐标: 51525727-51528253 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003283`
名称	SmilChr01G003283
描述	thioredoxin-like 2, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	51525727 - 51528253 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991633`
GeneID	`130991633`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991633`
原始查询	`LOC130991633`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	thioredoxin-like 2, chloroplastic
产物	thioredoxin-like 2%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT4G26160` (ACHT1) atypical CYS HIS rich thioredoxin 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828722] identity=72.2; qcov=0.586; evalue=4.83e-70; confidence=medium
Rice	`Os05g0200100` - identity=70.5; qcov=0.726; evalue=3.81e-80; confidence=high
GO	GO:0045454 (cell redox homeostasis)
KEGG	-
Pfam	PF00085 (Thioredoxin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991633

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057771933.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057771933.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771933.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771933.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771933.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:51525898`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B131,B68,C26
`Chr1:51525898`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B131,B68,C26
`Chr1:51525900`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B131,B68,C26
`Chr1:51525900`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B131,B68,C26
`Chr1:51525909`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr1:51525954`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B42,B43,C70,C85,C87
`Chr1:51526628`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B47,B73
`Chr1:51526685`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr1:51526755`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr1:51527388`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,C60
`Chr1:51527433`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr1:51527509`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B68,C26

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771933.1

215 aa

108

215

Thioredoxin

PF00085 Thioredoxin 87-182 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771933.1`	Pfam	`PF00085`	Thioredoxin	Domain	87	182	5.4e-17	62.4	Thioredoxin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915950.1
ACCTACAATCTTCTACTAATATTATTTCCCTGTCACTATCCTTCATATTTTTCATTTTTTATTTTTTATACCATAGCAATGCGCGAATATTTACGCAACAGAAGAGAAGAATTGTGAGGAAAGAGAGATTGTATACAATATGCTGGGGAAATCTGCCGTCCCACAAAATTCCTATGATACATCAAGAATTTCTCTAGGTTCAAGTCGGATTTATTATCTTCAGCTCCCGGGCGAATGCAAACCAAGTTCAAGAAATGGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991633
ATGCTGGGGAAATCTGCCGTCCCACAAAATTCCTATGATACATCAAGAATTTCTCTAGGTTCAAGTCGGATTTATTATCTTCAGCTCCCGGGCGAATGCAAACCAAGTTCAAGAAATGGCGGATTTTCATATTCATTTGCTGCTAAACCTCAAAAAAGAGGAATTTTCTTGTTAAAGGCACATGCTGCTGCTGCTGCTGAAACGAATCAGCCGAGATGGTGGGAAAAGAATGCTGGACCGAATATGATTGACATTAATTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771933.1
MLGKSAVPQNSYDTSRISLGSSRIYYLQLPGECKPSSRNGGFSYSFAAKPQKRGIFLLKAHAAAAAETNQPRWWEKNAGPNMIDINSTQEFVDALSQAGDRLVIVEFFGAWCASCRALFPKICRLADQHPEIIFLKVNFDENKPLCKSLNIKVLPYFHFYKGADGLVDSFSCSLAKLQKLKDAIATHNKARHSNSPPDCNGGIGDVSVSRDDKQL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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