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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000451`

染色体: Chr07 坐标: 3186255-3189161 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000451`
名称	SmilChr07G000451
描述	inactive beta-amylase 9
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	3186255 - 3189161 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991643`
GeneID	`130991643`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991643`
原始查询	`LOC130991643`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	inactive beta-amylase 9
产物	inactive beta-amylase 9
Arabidopsis	`AT5G18670` (BMY3) beta-amylase 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831985] identity=53.2; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0667100` (OsSTA201) - identity=47.4; qcov=0.84; evalue=8.48e-150; confidence=high
GO	GO:0000272 (polysaccharide catabolic process); GO:0016161 (beta-amylase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01373 (Glyco_hydro_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991643

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057771950.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057771950.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771950.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771950.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771950.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:3186441`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr7:3186488`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B125,B46,C2
`Chr7:3186574`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B108,C1
`Chr7:3186574`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B108,C1
`Chr7:3186620`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr7:3186639`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,B140
`Chr7:3186700`	`C`	`CGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C15
`Chr7:3186700`	`C`	`CGT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C15
`Chr7:3186768`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B108,C85,D11
`Chr7:3186775`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B68,C74
`Chr7:3186828`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr7:3186875`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C10,C14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771950.1

543 aa

272

543

Glyco_hydro_14

PF01373 Glyco_hydro_14 95-508 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771950.1`	Pfam	`PF01373`	Glyco_hydro_14	Domain	95	508	8.5e-92	309.0	Glycosyl hydrolase family 14

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915967.1
TTAAAGCCATACAAACATTTCATTTCCAATTTATTCCTATATATCTCTATCCATTTCCCCCATTAATTCCTCACATTTTTTTTCCCCTCCCATTTCTCAAAATTCTCCATTCCCATCGAAACCCATCAAAGAAAAATTCAACCTTTGTGGGATTTCATCCATTTTCTTGGATCAAATCCCCTTAGAAATCCTGTCATCTTGCACTTTTGCATAAAATTCCCAATTTTGTTGTTGGGTCCAAAACAAATATCCTCTCTCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991643
ATGGAGGTGTCTGTGATTGGGAGCTCACAGCTCAATCTTGGGAGGATTGATACGGTTGGGTTGTGTAATCTTAGAAGGAATTTGAATGTTAACATGTTGAGTTTTAAGAATAATTTTTCAAAGGGATGCAATATTGTTCAGAGCAGAAGATTTTTGTGGCCTTCGAGATCTCAAGTTCTTAGTCTTAGGGCATCTTCTTCTGCTCAAAACCAACCTCTTGTTTATGAGAAGAAAGCTTCAAATATTACAACAAACACAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771950.1
MEVSVIGSSQLNLGRIDTVGLCNLRRNLNVNMLSFKNNFSKGCNIVQSRRFLWPSRSQVLSLRASSSAQNQPLVYEKKASNITTNTTIDGTKLYVGLPLDTVSSCNSINHARAIAAGLKALKLLGVDGVELPVWWGVAENEAMGKYDWSSYLAIVEVVKSLDLELHVSLCFHASGDAKLPLPAWVSRIGESDPSIYFTDKSGQQYKDCLSLGVDDLPVLDGKTPLQVYKAFLESFKASFSPFMGSTITGLTIGLGPDGEL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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