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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000457`

染色体: Chr07 坐标: 3233129-3235669 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000457`
名称	SmilChr07G000457
描述	uncharacterized SmilChr07G000457
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	3233129 - 3235669 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991654`
GeneID	`130991654`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991654`
原始查询	`LOC130991654`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsFbox257; symbol=OsFbox257; hit=Os05g0372800; species=rice; confidence=medium
产物	OsFbox257; symbol=OsFbox257; hit=Os05g0372800; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G15563` (AT4G15563) F-box-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827231] identity=46.8; qcov=0.673; evalue=2.3e-44; confidence=medium
Rice	`Os05g0372800` (OsFbox257) - identity=44.7; qcov=0.908; evalue=1.28e-63; confidence=medium
GO	GO:0000209 (protein polyubiquitination); GO:0005515 (protein binding); GO:0019005 (SCF ubiquitin ligase complex); GO:0031146 (SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991654

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771967.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057771967.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771967.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771967.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771967.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:3233416`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:3233420`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B15,C37
`Chr7:3233437`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C29
`Chr7:3233439`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr7:3233446`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr7:3233447`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,B26
`Chr7:3233494`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:3233564`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr7:3234141`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,C29,C42
`Chr7:3234145`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,D9
`Chr7:3234146`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B72,B91,C72
`Chr7:3234188`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B38,B39,B59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771967.1

251 aa

126

251

F-box-like

F-box

PF12937 F-box-like 9-52 aa PF00646 F-box 10-49 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771967.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	9	52	3.7e-08	33.7	F-box-like
`XP_057771967.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	10	49	2.8e-07	30.9	F-box domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915984.1
AATGATACACTTGATCACTTTAAGGGGCATGTGGCCCATGCCCAAATTTCCCTCAAAATCAATGTTGACTTTTTTGAGTGAAGAGATGGAAGCTTTTCCTAATTCCACACAATCCCACGTGTGCACTTTACCTGTTTAGTGTAAGAATCTCTCTTCCACCTATGAAAGATAACAGAAACTCATTCGAAACATAAACTATCTCCTCATTTTCATCACTTTTTAATCGTTCATCACTCTTTTTTTTCAATTCATCCCAATAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991654
ATGCATCGATCAATCAATATACAGAATTCGCTCCCTTATGATCTTGCCCTCAAAATCGCCTCATCTCTTCAGGTTTTTGATGTGTGTTCATTAGGCAGTTGTTCGAGGTTTTGGAGGGAGCTGTGTGGGTCTGATTGTTTGTGGGAGGGTCTATGCAAAGACAGGTGGCCTGTAATTTTTGAGGATCAGAATTATCAGAGTGAAACCTACGATCAGAAATTGACCTCCAATTCGAAGGGATGGAGAGGTTTGTACGTAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771967.1
MHRSINIQNSLPYDLALKIASSLQVFDVCSLGSCSRFWRELCGSDCLWEGLCKDRWPVIFEDQNYQSETYDQKLTSNSKGWRGLYVSKHNEMAGKVESVADFVERALAYESIEVGNYLKAVELLSSHQFGFKDVQMFLLKPKLNVLLNLVGLHYCIIWLEIPAENVIEALDSSEVSDRQVCVQWWKLGRWFYGFRLRDEYHSKNVSLGDLAASNEEVLGVLHRGAIHEVIRVQISVAKSAHTSWSHQVAQV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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