当前解析结果
SmilChr07G000495| 统一新 Gene ID | SmilChr07G000495 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G000495 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G000495 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 3446894 - 3449094 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130991685 |
|---|---|
| GeneID | 130991685 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130991685 |
| 原始查询 | LOC130991685 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | E3 ubiquitin-protein ligase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831972]; symbol=AT5G18540; hit=AT5G18540; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | E3 ubiquitin-protein ligase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831972]; symbol=AT5G18540; hit=AT5G18540; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT5G18540 (AT5G18540)E3 ubiquitin-protein ligase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831972] identity=73.1; qcov=0.712; evalue=1.74e-41; confidence=medium |
| Rice | Os07g0669600 (P0625E02.128)- identity=69.5; qcov=0.651; evalue=1.35e-40; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130991685 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057772015.1 |
| 2 | Nucleolus | 核仁 | 0.80000 | XP_057772015.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.40000 | XP_057772016.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057772015.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057772015.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:3447292 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C48,C82 |
Chr7:3447298 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B77,C5 |
Chr7:3447445 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A11,B135,C64,C66 |
Chr7:3447623 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B140,B62 |
Chr7:3448428 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A21,B101,C20 |
Chr7:3448982 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A13,B37,C70,C82 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。