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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000507`

染色体: Chr07 坐标: 3565904-3568594 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000507`
名称	SmilChr07G000507
描述	putative F-box/LRR-repeat protein At3g18150
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	3565904 - 3568594 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991698`
GeneID	`130991698`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991698`
原始查询	`LOC130991698`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative F-box/LRR-repeat protein At3g18150
产物	putative F-box/LRR-repeat protein At3g18150
Arabidopsis	`AT5G56420` (AT5G56420) F-box/RNI-like/FBD-like domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835743] identity=28.1; qcov=0.512; evalue=2.72e-16; confidence=low
Rice	`Os10g0128200` (OsFbox517) - identity=28.1; qcov=0.569; evalue=3.68e-12; confidence=low
GO	GO:0005509 (calcium ion binding); GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991698

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772038.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772038.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772038.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772038.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057772038.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:3565967`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	57	A14,A16,A2,A3,A5,A7,A9,B102,B103,B115,B119,B120,B127,B129,B134,B136,B20,B22,B27,B31,B44,B54,B58,B65,B66,B67,B7,B78,B82,B86,B87,B89,B9,B94,C15,C26,C33,C36,C41,C44,C52,C58,C6,C60,C72,C75,C76,C79,C8,C83,C87,C9,D1,D10,D3,D4,D5
`Chr7:3565968`	`G`	`GCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	57	A14,A16,A2,A3,A5,A7,A9,B102,B103,B115,B119,B120,B127,B129,B134,B136,B20,B22,B27,B31,B44,B54,B58,B65,B66,B67,B7,B78,B82,B86,B87,B89,B9,B94,C15,C26,C33,C36,C41,C44,C52,C58,C6,C60,C72,C75,C76,C79,C8,C83,C87,C9,D1,D10,D3,D4,D5
`Chr7:3565974`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr7:3566054`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr7:3566157`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C25,C27,C47,C5,C55
`Chr7:3566160`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B72,B8
`Chr7:3566211`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B12,B55,C74
`Chr7:3566219`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B139,B97,C38
`Chr7:3566235`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr7:3566243`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr7:3566258`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr7:3566461`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B122,B124,B125,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772038.1

494 aa

247

494

F-box

LRR_At5g56370

PF00646 F-box 13-50 aa PF24758 LRR_At5g56370 116-236 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772038.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	13	50	3.8e-08	33.6	F-box domain
`XP_057772038.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	116	236	3e-12	47.4	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916055.1
AAACATGCAATTCAATAACTCAAGATTGCTTGAATTTAAGATCCATTTGGGTTTGAACTATTTTACTATCTGGGAACGAGTCTTACTCATCGTGTTGACACAATCAAATTGAAAACCATGTAAAGAGATATCAGCAAAGCCATATCTCATCTTCCTAATCTCTCTCTCTCTCTCTAAATTAATTAGCAGAGAATTTTATACCCCTTTCCACTTGAGAAAAATGAAGAAACGAAAGAAAAAAGCATGCCCGGACCGACTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991698
ATGAAGAAACGAAAGAAAAAAGCATGCCCGGACCGACTCAGCGAGTTACCAAACTCATTAATTCATCTAATCTTTTCATTCCTCCCAACCAAATACGCTGTTCGAACAACCCTTCTCTCCAAACGATGGAGAGATTTCTGGCTCACCGTGCCTACCCTCAATTTCCACGATCGCGATTTCCTCTACCGTCGCGAGGCACCACTCTTCGACTTCGTCGACCTCGCTCTCATTCTCTGGAACGGCGCACGCCTTTCCAGATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772038.1
MKKRKKKACPDRLSELPNSLIHLIFSFLPTKYAVRTTLLSKRWRDFWLTVPTLNFHDRDFLYRREAPLFDFVDLALILWNGARLSRFDLAFNYHRHESGEYESRSYRNYWSASLILDLWLRFAAENAVEELILDLIDGDDAKEGLFRETYWLPQRLYSCSSIRELSLAGCVVSINGGVNWDRLRVLRIEGSWLRGYNVGRVLRGAPRLEVLILRVFGGGGRLSIVSDSLKKVVVERYERGDGDDDGDLDYEEMKEVMDIC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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