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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000508`

染色体: Chr07 坐标: 3577751-3580240 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000508`
名称	SmilChr07G000508
描述	putative F-box protein At1g49610
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	3577751 - 3580240 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991699`
GeneID	`130991699`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991699`
原始查询	`LOC130991699`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative F-box protein At1g49610
产物	putative F-box protein At1g49610
Arabidopsis	`AT1G78760` (AT1G78760) F-box/RNI-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844212] identity=27.7; qcov=0.589; evalue=1.25e-18; confidence=low
Rice	`Os11g0202200` (OsFbox584) - identity=25.2; qcov=0.969; evalue=1.06e-15; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF12937 (F-box-like); PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991699

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772039.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772039.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772039.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772039.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057772039.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:3577965`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B47,B50,C22,C30,C77
`Chr7:3577976`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:3578027`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C33,C46
`Chr7:3578035`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B44,B95
`Chr7:3578199`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,C70,D7
`Chr7:3578224`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C29
`Chr7:3578263`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B110,C27,C5,D10
`Chr7:3578404`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr7:3579247`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B132
`Chr7:3579247`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B132
`Chr7:3579356`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B118,B20,C15,C4,C42
`Chr7:3579467`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B92,C70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772039.1

484 aa

242

484

F-box

F-box-like

LRR_At5g56370

PF00646 F-box 13-52 aa PF12937 F-box-like 14-46 aa PF24758 LRR_At5g56370 154-265 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772039.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	13	52	7.3e-08	32.7	F-box domain
`XP_057772039.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	14	46	6e-06	26.7	F-box-like
`XP_057772039.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	154	265	1.7e-11	44.9	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916056.1
TTGACAGAATTCCACGATCAGATTATCCCAATTTTCGCAACAAATCATGTAATCCACTACCAAAGCCCCCTTTTTCCCCGATTGAGGAATGCTCTGATCGAATTAGGGTTACAATTGAAGCTTGTTTAATTAAATTAGAAGAGATAACATCTAATTTCTGAAACCGCAATGGCAGAATCACAGAGTAATCAACGCGGCGACCGACTCAGTGAGTTGCCCGACTCGCTAATCCTTCACATCCTCTCCTTCCTCCCAATGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991699
ATGGCAGAATCACAGAGTAATCAACGCGGCGACCGACTCAGTGAGTTGCCCGACTCGCTAATCCTTCACATCCTCTCCTTCCTCCCAATGCGCCACGTCGTTCAGACAACCCTCCTCTCCAAGCGCTGGGCCGATCTATGGCGGACCGTCTCCTCCCTCACCTTCGACGACGGAACCAATGACGCGGCCGAACAAGAGCAATTCCTCGAATTCCCACTCTTCGTCAACCGCGCCATGAGTCTCTGGAAAGGGACCGAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772039.1
MAESQSNQRGDRLSELPDSLILHILSFLPMRHVVQTTLLSKRWADLWRTVSSLTFDDGTNDAAEQEQFLEFPLFVNRAMSLWKGTEILKFHAAFDYTCWDYASSDLDVWLRVAMDKQVQVLSLNLTKSEENINRYHRDDDSDIDDGDFGGDDLYTVPPRLFSCSSIRELSLAACNVRFGGNVRWDKLEFLKIEGVRLSDGLVGRVVSGSPRLEVLILRVVESHDDLNIQSESLRRLTVEKYYRGDPAKHTMLTIWAPNLE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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