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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000511`

染色体: Chr07 坐标: 3591901-3594051 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000511`
名称	SmilChr07G000511
描述	F-box/LRR-repeat protein At3g26922-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	3591901 - 3594051 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991703`
GeneID	`130991703`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991703`
原始查询	`LOC130991703`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/LRR-repeat protein At3g26922-like
产物	F-box/LRR-repeat protein At3g26922-like
Arabidopsis	`AT3G26922` (AT3G26922) F-box/RNI-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:7922367] identity=29.4; qcov=0.576; evalue=7.68e-21; confidence=low
Rice	`Os10g0128200` (OsFbox517) - identity=28.1; qcov=0.557; evalue=1.34e-16; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF12937 (F-box-like); PF23622 (LRR_At1g61320_AtMIF1); PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991703

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772042.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772042.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772042.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772042.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057772042.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:3592163`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	A9,B102,B22,B50,B57,B89,C44,C53,C6,C74
`Chr7:3592226`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr7:3592270`	`G`	`GGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B78,B87,C52
`Chr7:3592270`	`G`	`GGC`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B78,B87,C52
`Chr7:3592306`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	69	A13,A2,A20,A23,A3,A4,B107,B109,B11,B111,B114,B119,B122,B124,B125,B127,B129,B133,B134,B136,B137,B138,B140,B15,B24,B25,B29,B33,B38,B53,B55,B59,B6,B62,B63,B75,B78,B8,B82,B87,B89,B9,B93,B99,C12,C16,C20,C21,C23,C30,C33,C45,C46,C54,C56,C57,C6,C60,C67,C69,C72,C75,C79,C82,C84,C87,D1,D11,D5
`Chr7:3592316`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	59	A13,A2,A20,A23,A3,A4,B107,B109,B11,B111,B119,B122,B124,B125,B127,B133,B134,B136,B138,B140,B15,B24,B29,B33,B53,B59,B6,B62,B63,B75,B78,B8,B86,B87,B89,B9,B93,B99,C12,C16,C20,C23,C33,C45,C46,C54,C56,C57,C6,C69,C72,C75,C79,C82,C84,C87,D11,D3,D5
`Chr7:3592319`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	56	A13,A2,A20,A3,A4,B107,B109,B11,B111,B122,B124,B125,B127,B133,B134,B136,B138,B140,B15,B24,B29,B33,B53,B59,B6,B62,B63,B75,B78,B8,B86,B87,B89,B9,B93,B99,C12,C16,C20,C23,C33,C45,C46,C54,C56,C57,C6,C69,C72,C75,C82,C84,C87,D11,D3,D5
`Chr7:3592344`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	B104,B108,B120,B124,B2,B21,B39,B76,B82,C18,C41,C68,C70,C75
`Chr7:3592402`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	A23,B35,C7,C79
`Chr7:3592402`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	4	A23,B35,C7,C79
`Chr7:3592405`	`T`	`TCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	12	A4,B107,B11,B111,B127,B130,B15,B29,B53,B99,C34,C84
`Chr7:3592406`	`G`	`GGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	A23,B35,C7,C79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772042.1

460 aa

230

460

F-box

F-box-like

LRR_At1g61320_AtMIF1

LRR_At5g56370

PF00646 F-box 23-61 aa PF12937 F-box-like 24-56 aa PF23622 LRR_At1g61320_AtMIF1 86-427 aa PF24758 LRR_At5g56370 104-348 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772042.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	23	61	1.6e-09	38.0	F-box domain
`XP_057772042.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	24	56	1.3e-05	25.5	F-box-like
`XP_057772042.1`	Pfam	`PF23622`	LRR_At1g61320_AtMIF1	Repeat	86	427	4.3e-09	37.0	At1g61320/AtMIF1, LRR domain
`XP_057772042.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	104	348	5.4e-09	36.8	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916059.1
GGAATATCCGAACCAAGATAAAAAGAACGTTTCTTGGAGGAAATGCTAATCTTTTATCTTCTCTCTTCTAAAGCATACTTTACCCATTTACAGTAGGGTTTTCACTTTTTCTGGTGATCGAAAATTATTTCCATAAAATCATATAATCCCAAGAAGCGGATCAGTTTTTAGTTCTATTTGGATTTGGATTAGTGAAACAATGGATGAATGGCACAATCGATTCAGTGAAGAAGCAAACATCGGTGAGCTCCACCGTCAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991703
ATGGATGAATGGCACAATCGATTCAGTGAAGAAGCAAACATCGGTGAGCTCCACCGTCAAGATCGACTCAGTGAGTTACCCGACTCTTTAATTCTTGAAATCCTTTCATTGTTGGATATCAAAGATGTTGTTCGGACATCCCTTCTCTCCAAAGGTTGGAAAAACCTCTGGTCCACCATCCCCTGCCTCTGCCTTGATTTCTTCGAACAAACTCCAAGTGTTATCTCTAGTGTTCTTTCACAATGGAAAGGCCCCAAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772042.1
MDEWHNRFSEEANIGELHRQDRLSELPDSLILEILSLLDIKDVVRTSLLSKGWKNLWSTIPCLCLDFFEQTPSVISSVLSQWKGPKILKFSFSFRRFFDPCSVIDSWLLFAIEKQVEELLLVLPNWPTLDTDEKVDYCLPQPLYSCSSITKLTLEGCQLKIEDNVQWHQLKRLEIRFPEWLSGDAVNQILLGAPLLEEFVLKCPKICENEYFNIQSTSLKMLKIQTGYIWRATTVLRIWAPNLLNFSIEAHFCGTCLLDV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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