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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000523`

染色体: Chr07 坐标: 3655179-3656943 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000523`
名称	SmilChr07G000523
描述	F-box/LRR-repeat protein At3g26922-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	3655179 - 3656943 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991711`
GeneID	`130991711`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991711`
原始查询	`LOC130991711`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/LRR-repeat protein At3g26922-like
产物	F-box/LRR-repeat protein At3g26922-like
Arabidopsis	`AT5G22670` (AT5G22670) F-box/RNI-like/FBD-like domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832330] identity=27.9; qcov=1.03; evalue=2.28e-20; confidence=low
Rice	`Os10g0128200` (OsFbox517) - identity=25.5; qcov=0.929; evalue=1.31e-18; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF08387 (FBD); PF23622 (LRR_At1g61320_AtMIF1); PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991711

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772055.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772055.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772055.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772055.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057772055.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:3655264`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B33,B35,B53
`Chr7:3655495`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	14	B128,B129,B18,B35,B47,B91,C12,C2,C24,C30,C43,C45,C75,D1
`Chr7:3655517`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B35,B91,C24,C30,C43
`Chr7:3655555`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B35,B91,C24,C43
`Chr7:3655761`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B100,B129,B21,B99
`Chr7:3655887`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	A22,B129
`Chr7:3655887`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	CDS_variant	2	A22,B129
`Chr7:3655908`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B124,D5
`Chr7:3655967`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,B33,B53
`Chr7:3656003`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C13,C47,C8
`Chr7:3656030`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,C18,C70
`Chr7:3656061`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B78,B87,C52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772055.1

435 aa

218

435

F-box

LRR_At1g61320_AtMIF1

LRR_At5g56370

FBD

PF00646 F-box 6-45 aa PF23622 LRR_At1g61320_AtMIF1 73-403 aa PF24758 LRR_At5g56370 95-213 aa PF08387 FBD 362-397 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772055.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	6	45	1.8e-05	25.1	F-box domain
`XP_057772055.1`	Pfam	`PF23622`	LRR_At1g61320_AtMIF1	Repeat	73	403	4.6e-11	43.4	At1g61320/AtMIF1, LRR domain
`XP_057772055.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	95	213	8.6e-10	39.4	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats
`XP_057772055.1`	Pfam	`PF08387`	FBD	Repeat	362	397	8.9e-08	32.6	FBD

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916072.1
CGCACTGCTGCTTCTCCGCGTCGATCGACCGACCGAAAAATCGATTACACCGTCGGCAAGAGTTTTGAGTAGTGAAACAATGGATGATGATCGACTCAGTGAGTTACCTGACTCGTTAATCCTCTCCATTCTTTCGTTGTTAAATATGAAAGACGTGGTTATGACAACCTTTCTCTCCAAAGGATGGAAAAATCGATGGACCACTGTCCCCAGCCTTGATTTTGGCATTCCTTTCACCCGTAATAAGTGGGTTGAATATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991711
ATGGATGATGATCGACTCAGTGAGTTACCTGACTCGTTAATCCTCTCCATTCTTTCGTTGTTAAATATGAAAGACGTGGTTATGACAACCTTTCTCTCCAAAGGATGGAAAAATCGATGGACCACTGTCCCCAGCCTTGATTTTGGCATTCCTTTCACCCGTAATAAGTGGGTTGAATATTCAAAGTTTGTTTCTGGGGCTCTTGCACAATGGAAAGGTACCAAGATTCTGGACTTCACCATATACTTCTCCTCCTCCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772055.1
MDDDRLSELPDSLILSILSLLNMKDVVMTTFLSKGWKNRWTTVPSLDFGIPFTRNKWVEYSKFVSGALAQWKGTKILDFTIYFSSSSYYPSSCDIDSWLLLAIEKQVEKLIVVFKCKPPGAYFVPQCLYSCSSITELSLYKCSLKIERNVQWNKLKRLEFLYPDGLSGDTMNQILLGAPLLEELVLWSFEISENFNIRSTSLKILEIIGCDVKAEAELRIWAPDVLSLEISGDVCGSCLLYVPSLTTATLCFDDFSITRE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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