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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000528`

染色体: Chr07 坐标: 3679464-3681452 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000528`
名称	SmilChr07G000528
描述	F-box protein At5g03100-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	3679464 - 3681452 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991715`
GeneID	`130991715`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991715`
原始查询	`LOC130991715`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein At5g03100-like
产物	F-box protein At5g03100-like
Arabidopsis	`AT5G22730` (AT5G22730) F-box/RNI-like/FBD-like domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832336] identity=25.7; qcov=1.03; evalue=6.83e-21; confidence=low
Rice	`Os11g0208000` (OsFbox587) - identity=25.1; qcov=0.979; evalue=3.31e-12; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991715

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772058.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057772058.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057772058.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772058.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772058.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:3679650`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	206	A10,A11,A14,A15,A16,A18,A19,A2,A20,A21,A22,A23,A24,A25,A4,A5,A7,A9,B10,B100,B101,B102,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B11,B111,B112,B113,B114,B117,B118,B119,B12,B121,B122,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B134,B135,B137,B138,B139,B14,B15,B16,B17,B19,B2,B20,B22,B23,B25,B26,B27,B28,B29,B30,B34,B35,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B44,B45,B46,B47,B49,B50,B51,B52,B54,B56,B58,B59,B6,B61,B63,B64,B69,B7,B70,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B77,B78,B79,B8,B80,B81,B82,B84,B85,B87,B88,B89,B9,B91,B93,B94,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C16,C17,C18,C2,C20,C22,C23,C25,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C45,C47,C50,C51,C52,C53,C54,C55,C56,C57,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C64,C66,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C76,C77,C78,C79,C8,C80,C81,C82,C84,C85,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D5,D7,D8,D9
`Chr7:3679682`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B78,B87,C52
`Chr7:3679726`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A25,A6,B17,B31,B61,B65,C31,C40,C63
`Chr7:3679741`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	33	A15,A24,A7,B104,B112,B118,B121,B134,B135,B2,B20,B37,B38,B39,B69,B78,B88,C2,C3,C36,C52,C61,C64,C67,C68,C7,C71,C74,C78,C82,C84,C85,C86
`Chr7:3679744`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	27	A15,A24,A7,B104,B112,B118,B121,B134,B2,B20,B37,B39,B69,B78,B88,C2,C3,C36,C52,C61,C64,C67,C68,C78,C84,C85,C86
`Chr7:3679788`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B69,B78,C68
`Chr7:3679788`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B69,B78,C68
`Chr7:3679828`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	18	A15,A24,B108,B114,B134,B22,B88,C17,C28,C3,C32,C36,C61,C68,C70,C71,C77,D2
`Chr7:3679847`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,C32,C68
`Chr7:3679864`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C2
`Chr7:3679864`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C2
`Chr7:3679882`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772058.1

439 aa

220

439

F-box

LRR_At5g56370

PF00646 F-box 13-51 aa PF24758 LRR_At5g56370 92-208 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772058.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	13	51	7.7e-08	32.7	F-box domain
`XP_057772058.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	92	208	4.4e-09	37.1	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916075.1
AGGGTAAGCTGTAAGTCGCCTCTTCTGGTGATCACTCATCAGCCACCGCCACCACTCTCATTGTTGAGTGCTGCTATCTCTCAATTGAAATCACATCTAAGAAAGTAGGTCTTTTTTAGTTGAATTTGACTGCACGGTTAAACAAGTAATGGATTGCTCGCAATCTTATGATCACCGTGATCGACTAAGTGCGTTGCCCGACTCCTTAATCCTCACGATTCTTTCTCTGTTGGAAACGCGGTATATTGTTTGGACAGCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991715
ATGGATTGCTCGCAATCTTATGATCACCGTGATCGACTAAGTGCGTTGCCCGACTCCTTAATCCTCACGATTCTTTCTCTGTTGGAAACGCGGTATATTGTTTGGACAGCACTGCTCTCCAAACGTTGGAGAGATCTTTGGACCACCGTTCCCGGTCTGAAATTCGTAGAAGAAGATAGAAATTTCATTTGTGGAGTAGTTTCGAAATTTAGAGGTGCAAAGATCGTCAGCTTCTACTTTGAATTGCTCTACGAGCTCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772058.1
MDCSQSYDHRDRLSALPDSLILTILSLLETRYIVWTALLSKRWRDLWTTVPGLKFVEEDRNFICGVVSKFRGAKIVSFYFELLYELPLASDVDSWLLFAVEKQVEELHIYLGSHPDTPYCLPQFFYSCSSITKLLLINCSLQIEGSVQLNQLESLSIHLRDSSCDAAMNKLLLGAPRLEEMILLIDEINQNFSIRSTSLKNLIIDSHRPFSTEIRAVLRICAPNLLTLRIRAALVNGGSCLWDVPSLTEACLRYFSDADD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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