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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000529`

染色体: Chr07 坐标: 3681772-3683886 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000529`
名称	SmilChr07G000529
描述	putative F-box protein At1g49610
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	3681772 - 3683886 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991716`
GeneID	`130991716`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991716`
原始查询	`LOC130991716`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative F-box protein At1g49610
产物	putative F-box protein At1g49610
Arabidopsis	`AT5G53840` (AT5G53840) F-box/RNI-like/FBD-like domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835465] identity=24.6; qcov=0.99; evalue=1.14e-19; confidence=weak
Rice	`Os10g0128200` (OsFbox517) - identity=25.6; qcov=0.455; evalue=2.97e-11; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991716

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772059.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057772059.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772059.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772059.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772059.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:3681914`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:3682055`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B101,C45
`Chr7:3682056`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B65,C27
`Chr7:3682064`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr7:3682100`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	198	A1,A10,A11,A13,A18,A19,A2,A20,A23,A3,A4,A5,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B102,B103,B104,B105,B106,B107,B109,B11,B110,B111,B112,B113,B115,B117,B118,B119,B12,B120,B121,B123,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B18,B2,B20,B21,B22,B23,B27,B28,B29,B3,B31,B34,B35,B37,B38,B39,B40,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B48,B50,B51,B53,B54,B55,B57,B59,B6,B61,B63,B64,B66,B67,B68,B69,B7,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B77,B79,B81,B82,B83,B84,B85,B86,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B97,B98,B99,C1,C12,C13,C14,C15,C16,C18,C2,C20,C21,C23,C24,C26,C28,C29,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C5,C50,C51,C52,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C62,C64,C65,C66,C67,C68,C7,C70,C71,C72,C75,C76,C78,C79,C8,C80,C81,C82,C83,C84,C86,C87,D1,D11,D2,D3,D4,D6,D8,D9
`Chr7:3682114`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B87,C52
`Chr7:3682129`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,B44
`Chr7:3682220`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B128,B136,C44,C59
`Chr7:3682414`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	C10,C14,C73
`Chr7:3682414`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	C10,C14,C73
`Chr7:3682437`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B140,C32,C68
`Chr7:3682437`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B140,C32,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772059.1

505 aa

252

505

F-box

LRR_At5g56370

PF00646 F-box 15-55 aa PF24758 LRR_At5g56370 153-245 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772059.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	15	55	0.00041	20.9	F-box domain
`XP_057772059.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	153	245	2.8e-09	37.7	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916076.1
CCAAACTTTCGTTTGGTGGTTTAAGGCGTATAAGAAACTTCCTTCCCTAAACCCTATAATCAGTTTGAAGAATTGGATAGTTCTAAGCCCTTGTCAAACAATGGATAAATCGCAGGATTCCGAATCAGATAGCCTCGATCGACTGAGTGAGTTGCCCGATTCCTTAATACTTTCGATTCTTTCGTTGTTGTCGTTGACGAGAGATGTTGTTAGGACAACCGTTCTCTCCAAACGTTGGAAAGATCTCTGGACCACCGTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991716
ATGGATAAATCGCAGGATTCCGAATCAGATAGCCTCGATCGACTGAGTGAGTTGCCCGATTCCTTAATACTTTCGATTCTTTCGTTGTTGTCGTTGACGAGAGATGTTGTTAGGACAACCGTTCTCTCCAAACGTTGGAAAGATCTCTGGACCACCGTCCCCTGTCTTTATTTCCGGGATCCTCCTACTTTAGATGAGCACCGAAACTTTATATCTGCGGCTCTTGCACAGTGGAAAGGTGCCAAGATTCAGAAATTCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772059.1
MDKSQDSESDSLDRLSELPDSLILSILSLLSLTRDVVRTTVLSKRWKDLWTTVPCLYFRDPPTLDEHRNFISAALAQWKGAKIQKFDIVYQLDSYSDSDVDSTEYFSETRRDFDLWLLLAIEKQVEELIIDMEFYEDIFDMKFRESVFYPYYNKDCEYCAPQRLYSCSSITKLSLSTCKLIIEGNVQWNQLKSLTINGIESWSEDAMNRLVCGSPQLEELNLIFGKILQNLNIRSSSLKNLKISDDDGVLFSTDIKGDLT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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