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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000532`

染色体: Chr07 坐标: 3690994-3692627 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000532`
名称	SmilChr07G000532
描述	putative FBD-associated F-box protein At3g50710
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	3690994 - 3692627 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991718`
GeneID	`130991718`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991718`
原始查询	`LOC130991718`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative FBD-associated F-box protein At3g50710
产物	putative FBD-associated F-box protein At3g50710
Arabidopsis	`AT3G50710` (AT3G50710) F-box/RNI-like/FBD-like domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824235] identity=27.8; qcov=0.757; evalue=3.18e-16; confidence=low
Rice	`Os10g0128200` (OsFbox517) - identity=26.2; qcov=0.691; evalue=1.57e-12; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF12937 (F-box-like); PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991718

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772063.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057772063.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772063.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772063.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772063.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:3691073`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B137
`Chr7:3691073`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137
`Chr7:3691120`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:3691416`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr7:3691449`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C27
`Chr7:3691449`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C27
`Chr7:3691451`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C27,C77
`Chr7:3691469`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr7:3691483`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B78,B87,C52
`Chr7:3691485`	`GAT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	60	A13,A16,A20,A21,A23,A5,B101,B105,B106,B113,B114,B115,B122,B134,B16,B18,B33,B36,B53,B54,B58,B59,B62,B64,B69,B71,B77,B79,B81,B84,B86,B90,B92,B97,C11,C13,C16,C2,C23,C3,C33,C36,C4,C43,C44,C52,C53,C54,C58,C6,C67,C81,C86,C87,D1,D11,D2,D4,D5,D9
`Chr7:3691507`	`GAC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	66	A1,A13,A16,A19,A20,A21,A23,A5,B1,B101,B105,B106,B11,B113,B114,B115,B122,B126,B127,B134,B135,B16,B18,B33,B36,B53,B54,B59,B62,B64,B66,B69,B71,B77,B79,B81,B84,B86,B90,B92,B94,C11,C13,C16,C2,C23,C3,C36,C4,C43,C52,C53,C54,C56,C58,C6,C62,C67,C81,C86,C87,D1,D2,D3,D4,D5
`Chr7:3691550`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	92	A1,A13,A16,A18,A19,A2,A20,A21,A23,A5,B1,B10,B101,B105,B106,B107,B11,B113,B114,B115,B122,B126,B127,B129,B130,B134,B135,B140,B16,B18,B20,B27,B28,B33,B36,B38,B53,B54,B58,B59,B62,B64,B66,B67,B69,B7,B71,B77,B79,B81,B84,B86,B88,B89,B90,B92,B93,B94,B97,B99,C11,C13,C14,C16,C2,C23,C3,C33,C36,C4,C43,C44,C46,C52,C53,C54,C56,C58,C6,C62,C67,C74,C79,C82,C86,C87,D1,D2,D3,D4,D5,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772063.1

404 aa

202

404

F-box-like

F-box

LRR_At5g56370

PF12937 F-box-like 38-71 aa PF00646 F-box 38-73 aa PF24758 LRR_At5g56370 163-259 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772063.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	38	71	1.1e-08	35.5	F-box-like
`XP_057772063.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	38	73	3.1e-10	40.2	F-box domain
`XP_057772063.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	163	259	6.4e-07	30.0	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916080.1
TTCTGTTGATCGAAAACTATTTCAATAAAATCATTTAATCCCAATAATCAGTTTTAAAGAGTGAAACAATGGATGAATGGCACGATCGATTCAGTGAAGAAGCACATATCGGTGAGCTCCACGATCGAGATCGACTCAGTGAAGAAGCAAACATCGGTGAGCTCCATGATCGCGATCGATTCAGTGAGTTACCCAACTCTTTAATTATTGAAATCTTTTCATTGTTGGATATCAAAGATGTTGTTCGGACATCCCTTGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991718
ATGGATGAATGGCACGATCGATTCAGTGAAGAAGCACATATCGGTGAGCTCCACGATCGAGATCGACTCAGTGAAGAAGCAAACATCGGTGAGCTCCATGATCGCGATCGATTCAGTGAGTTACCCAACTCTTTAATTATTGAAATCTTTTCATTGTTGGATATCAAAGATGTTGTTCGGACATCCCTTGTCTCCAAACGTTGGGAAAACCTCTGGTACACCATCCCCTGCCTTGATCTCTTGGAACAAACTCCAAGTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772063.1
MDEWHDRFSEEAHIGELHDRDRLSEEANIGELHDRDRFSELPNSLIIEIFSLLDIKDVVRTSLVSKRWENLWYTIPCLDLLEQTPSFISSVVSLWKGPKILKFCLSFPPYNVKPCSVIDSWLLFAIEKRVGELYLDLSNWRDLNAIKKRLGECFSYWRDLDRYKKVDYCLPQPLYSCSSITKLTLVSCKLRIEDNVQWNQLKSLEITYPDWLSGDAMNQILLGAPLLEELVLKSFKIGEKENFNIRSTSLKMLKIQTGYI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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