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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000534`

染色体: Chr07 坐标: 3710408-3712902 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000534`
名称	SmilChr07G000534
描述	F-box protein At5g03100-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	3710408 - 3712902 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991719`
GeneID	`130991719`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991719`
原始查询	`LOC130991719`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein At5g03100-like
产物	F-box protein At5g03100-like
Arabidopsis	`AT5G56440` (AT5G56440) F-box/RNI-like/FBD-like domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835745] identity=30.8; qcov=0.562; evalue=2.98e-19; confidence=low
Rice	`Os06g0556300` (OsFbox313) - identity=28; qcov=0.609; evalue=7.26e-12; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991719

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772064.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772064.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772064.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772064.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057772064.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:3710493`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	57	A1,A11,A13,A25,A3,A4,A8,B104,B11,B114,B117,B12,B122,B128,B13,B20,B25,B28,B35,B45,B48,B5,B53,B55,B65,B66,B67,B69,B71,B72,B74,B77,B79,B8,B83,B91,B93,B94,C12,C18,C21,C27,C28,C34,C35,C37,C42,C5,C51,C58,C59,C65,C70,C83,C86,D5,D8
`Chr7:3710517`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B82,C83
`Chr7:3710612`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	161	A1,A10,A14,A15,A16,A18,A19,A20,A21,A22,A23,A3,A6,A7,A9,B10,B101,B102,B103,B106,B107,B109,B112,B113,B117,B118,B120,B121,B122,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B130,B132,B135,B136,B137,B138,B139,B140,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B22,B23,B25,B26,B27,B29,B3,B30,B31,B34,B36,B37,B38,B39,B40,B41,B42,B43,B44,B46,B47,B5,B50,B54,B57,B58,B59,B6,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B68,B7,B70,B71,B73,B75,B76,B78,B81,B82,B84,B86,B89,B9,B93,B94,B97,C10,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C2,C20,C23,C24,C25,C26,C29,C3,C31,C34,C36,C4,C41,C43,C44,C45,C46,C47,C5,C50,C53,C54,C55,C56,C59,C6,C60,C62,C63,C64,C66,C67,C68,C71,C72,C73,C78,C79,C8,C80,C81,C82,C85,C86,C9,D1,D10,D11,D4,D5,D6,D7,D9
`Chr7:3710749`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C13,C34,C54,C56,C67
`Chr7:3711297`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,B105
`Chr7:3711306`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B105,B137,C61
`Chr7:3711368`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr7:3711571`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	8	A8,B100,B42,B48,B88,C11,C28,C45
`Chr7:3711572`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	A8,B100,B42,B48,B88,C11,C28,C45
`Chr7:3711635`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B104
`Chr7:3711635`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B104
`Chr7:3711696`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772064.1

463 aa

232

463

F-box

LRR_At5g56370

PF00646 F-box 24-64 aa PF24758 LRR_At5g56370 103-242 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772064.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	24	64	5e-08	33.3	F-box domain
`XP_057772064.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	103	242	1.4e-09	38.7	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916081.1
GGCTCCCTCTCTCACTCTAGCTCTTCTTCTCTTCCCCTCACTCTCACCACCGCCCACCCCTCTCTCTCCCACGTGCAGCCATCTCCCCTTCCTCTTCCGGCGAAATCATCGCCGGAATTTATTCTCTTGGATGCTCGCCTCCCTTCGTCGCCCAGCCCCTGCCGACATTACTTTCCTACTTTACTCACAGACTCTTGTGTTGTTTACAGAGAAAAGGCTTCGCCATCAATGACTTCTTCGAGCCTTATTGATCAACAAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991719
ATGACTTCTTCGAGCCTTATTGATCAACAAGTGGAAGCTGCAGCTTTGAAAGTGGGTGTGAGGGATCGATTAAGTGCGTTACCTGACTCCTTAATTCTTGAGATTCTCTCACTATTGGAAACGCGGTATGCTGTTAGAACAACATTTCTCTCCAAACGTTGGAGAGATCTTTGGACCACCGTGCCCCGCCTGAAATTCGTACATGAAAATCCACATTTTATTTATCGAGTTCTTGTGAGATGGAGAGGTGCAAAGATTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772064.1
MTSSSLIDQQVEAAALKVGVRDRLSALPDSLILEILSLLETRYAVRTTFLSKRWRDLWTTVPRLKFVHENPHFIYRVLVRWRGAKIVGFYLQLSYEEFCFSDVDSWLLFTVEKQVEELHIIVLSFDRTPYYCPPQRLYSCSSITELHLGCYCSLEIGGSVQWNRLKSLCIKVPNSSCDDAVNKLLLGAPCLEEMTLSVIVKSDENFSIRSISLKKLKIDGPVDVKAILSIWAPNLLTLVIGEYVVAGGGCLFYVPSLTKA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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