当前解析结果
SmilChr07G000535| 统一新 Gene ID | SmilChr07G000535 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G000535 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G000535 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 3714267 - 3715067 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130991721 |
|---|---|
| GeneID | 130991721 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130991721 |
| 原始查询 | LOC130991721 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130991721 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057772066.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057772066.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057772066.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057772066.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057772066.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:3714421 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 80 | A1,A13,A15,A16,A2,A24,A5,B1,B100,B105,B108,B11,B112,B114,B120,B123,B127,B13,B134,B137,B138,B22,B28,B3,B30,B31,B33,B35,B4,B44,B53,B55,B58,B63,B68,B7,B70,B76,B79,B83,B85,B88,B89,B95,C11,C13,C17,C2,C21,C23,C26,C28,C3,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C38,C43,C46,C47,C5,C51,C52,C56,C58,C61,C68,C69,C70,C71,C75,C77,C79,C8,D2,D3,D9 |
Chr7:3714449 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | D10 |
Chr7:3714449 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr7:3714489 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr7:3714509 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 4 | B140,B40,C32,C68 |
Chr7:3714509 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B140,B40,C32,C68 |
Chr7:3714555 |
CG |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 24 | A4,B109,B129,B133,B21,B27,B29,B3,B34,B4,B45,B54,B78,B87,C12,C15,C21,C30,C41,C42,C52,C63,C75,D10 |
Chr7:3714682 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr7:3714727 |
A |
AT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 6 | B3,B54,C15,C21,C42,D10 |
Chr7:3714994 |
G |
GCT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 21 | A15,A24,A8,B10,B107,B108,B114,B121,B134,B22,B70,B90,C21,C28,C32,C36,C61,C68,C69,C71,C77 |
Chr7:3715003 |
TTC |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 19 | A15,A24,B10,B107,B108,B114,B121,B134,B70,B90,C21,C28,C32,C36,C61,C68,C69,C71,C77 |
Chr7:3715014 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B3,B54,C12,C42 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。