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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000552`

染色体: Chr07 坐标: 3806017-3808088 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000552`
名称	SmilChr07G000552
描述	F-box/LRR-repeat protein At3g26922-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	3806017 - 3808088 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991731`
GeneID	`130991731`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991731`
原始查询	`LOC130991731`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/LRR-repeat protein At3g26922-like
产物	F-box/LRR-repeat protein At3g26922-like
Arabidopsis	`AT3G26922` (AT3G26922) F-box/RNI-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:7922367] identity=29.1; qcov=0.668; evalue=9.67e-21; confidence=low
Rice	`Os02g0493100` (OsRALyase) - identity=28.3; qcov=0.533; evalue=4.54e-14; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF23622 (LRR_At1g61320_AtMIF1); PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991731

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772079.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772079.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772079.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772079.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057772079.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:3806243`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	A3,B76,C4,C40,C8
`Chr7:3806243`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	CDS_variant	5	A3,B76,C4,C40,C8
`Chr7:3806253`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	A3,B76,C4,C40,C8
`Chr7:3806253`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	5	A3,B76,C4,C40,C8
`Chr7:3806257`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A3,B76,C4,C40,C8
`Chr7:3806257`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B76,C4,C40,C8
`Chr7:3806267`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	60	A10,A15,A18,A21,A23,A24,A3,B10,B101,B11,B111,B112,B126,B130,B133,B134,B136,B14,B16,B22,B23,B29,B35,B4,B45,B58,B6,B63,B69,B78,B83,B87,C18,C2,C28,C3,C32,C36,C37,C40,C41,C57,C67,C69,C7,C70,C71,C73,C74,C77,C78,C8,C82,C83,C84,C86,D1,D10,D2,D9
`Chr7:3806269`	`A`	`ACC`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	A3,C40,C8
`Chr7:3806269`	`A`	`ACC`	2bp_insertion	CDS_variant	3	A3,C40,C8
`Chr7:3806276`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,C71
`Chr7:3806311`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B15
`Chr7:3806345`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772079.1

448 aa

224

448

F-box

LRR_At1g61320_AtMIF1

LRR_At5g56370

PF00646 F-box 16-56 aa PF23622 LRR_At1g61320_AtMIF1 76-402 aa PF24758 LRR_At5g56370 96-226 aa

XP_057772080.1

437 aa

218

437

F-box

LRR_At1g61320_AtMIF1

LRR_At5g56370

PF00646 F-box 16-56 aa PF23622 LRR_At1g61320_AtMIF1 76-393 aa PF24758 LRR_At5g56370 96-226 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772079.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	16	56	0.00019	21.9	F-box domain
`XP_057772079.1`	Pfam	`PF23622`	LRR_At1g61320_AtMIF1	Repeat	76	402	8.4e-10	39.3	At1g61320/AtMIF1, LRR domain
`XP_057772079.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	96	226	1e-10	42.4	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats
`XP_057772080.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	16	56	0.00019	21.9	F-box domain
`XP_057772080.1`	Pfam	`PF23622`	LRR_At1g61320_AtMIF1	Repeat	76	393	7.3e-10	39.5	At1g61320/AtMIF1, LRR domain
`XP_057772080.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	96	226	1e-10	42.4	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916097.1
TGAATTCTTTTTCTCCCCTTTCAGAAAACCCTAGCTCCTCCCCCAATTATCTTCTTAACTTCTTCTCCTTTTCTCTTTCCTTCTCACAATGGCTTCCTCGCACTTTCCTCGGATTCCCGACAGCTACGATCGACTCAGTGAGTTACCCGATTCCTTAATACTTTCGATTCTTTCGTTGTTGCCGTCGACGAGAGATGTTGTTAGGACAACCATTCTGTCGAAACGCTGGAAAGATCTGTGGACCACCGTCCCCTGCCTTG...

XM_057916096.1
TGAATTCTTTTTCTCCCCTTTCAGAAAACCCTAGCTCCTCCCCCAATTATCTTCTTAACTTCTTCTCCTTTTCTCTTTCCTTCTCACAATGGCTTCCTCGCACTTTCCTCGGATTCCCGACAGCTACGATCGACTCAGTGAGTTACCCGATTCCTTAATACTTTCGATTCTTTCGTTGTTGCCGTCGACGAGAGATGTTGTTAGGACAACCATTCTGTCGAAACGCTGGAAAGATCTGTGGACCACCGTCCCCTGCCTTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130991731
ATGGCTTCCTCGCACTTTCCTCGGATTCCCGACAGCTACGATCGACTCAGTGAGTTACCCGATTCCTTAATACTTTCGATTCTTTCGTTGTTGCCGTCGACGAGAGATGTTGTTAGGACAACCATTCTGTCGAAACGCTGGAAAGATCTGTGGACCACCGTCCCCTGCCTTGTGTTCAGAAACGAAAATCCAGAGTTTATTTGTGGGGTTGTTGCACAATGGCGAGGTGCCAAGCTCCTGAGGTTTCATCTCCGCTGTTG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057772079.1
MASSHFPRIPDSYDRLSELPDSLILSILSLLPSTRDVVRTTILSKRWKDLWTTVPCLVFRNENPEFICGVVAQWRGAKLLRFHLRCWDSLSTSSDVESWLLFAVEKQVEELTLYTNYIPYYRPQSLYSCSSITTLHLQYCSLEIEGSVQLNQLETLSILAPFPSWADGINKILLGAPRLENMSLSSVEIDGNFNITSRSLETLIIRYAKIKGVITISAPNLLTLRIHVYTYNGASFLCNVPSLTEACFEKYYGADDRHFD...

XP_057772080.1
MASSHFPRIPDSYDRLSELPDSLILSILSLLPSTRDVVRTTILSKRWKDLWTTVPCLVFRNENPEFICGVVAQWRGAKLLRFHLRCWDSLSTSSDVESWLLFAVEKQVEELTLYTNYIPYYRPQSLYSCSSITTLHLQYCSLEIEGSVQLNQLETLSILAPFPSWADGINKILLGAPRLENMSLSSVEIDGNFNITSRSLETLIIRYAKIKGVITISAPNLLTLRIHVYTYNGASFLCNVPSLTEACFEKYYGADDRHFD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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