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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000551`

染色体: Chr07 坐标: 3796234-3798419 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000551`
名称	SmilChr07G000551
描述	F-box/FBD/LRR-repeat protein At3g26920-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	3796234 - 3798419 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991734`
GeneID	`130991734`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991734`
原始查询	`LOC130991734`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/FBD/LRR-repeat protein At3g26920-like
产物	F-box/FBD/LRR-repeat protein At3g26920-like
Arabidopsis	`AT5G56440` (AT5G56440) F-box/RNI-like/FBD-like domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835745] identity=31.3; qcov=0.591; evalue=1.1e-20; confidence=low
Rice	`Os10g0128600` (OsFbox518) - identity=25; qcov=0.922; evalue=6.86e-13; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF23622 (LRR_At1g61320_AtMIF1); PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991734

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772084.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772084.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772084.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772084.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057772084.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:3796409`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B100,B97,C38
`Chr7:3796426`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr7:3796453`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,B41,C10
`Chr7:3796481`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,B41,C10
`Chr7:3796530`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr7:3796606`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	B102,B119,B124,B136,B18,B61,B85,C12,D10
`Chr7:3796611`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	9	B102,B119,B124,B136,B18,B61,B85,C12,D10
`Chr7:3796651`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B119,B124,B136,B18,B85
`Chr7:3797015`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B100,B97,C38
`Chr7:3797051`	`A`	`ACG`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B31,B95
`Chr7:3797051`	`A`	`ACG`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B31,B95
`Chr7:3797064`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	79	A1,A14,A15,A18,A20,A24,B101,B106,B108,B112,B114,B118,B124,B128,B129,B130,B131,B134,B135,B137,B15,B19,B20,B22,B26,B28,B3,B32,B34,B36,B4,B41,B49,B54,B64,B68,B73,B79,B8,B80,B82,B84,B88,B89,B9,B94,C10,C13,C15,C17,C2,C21,C25,C3,C32,C34,C35,C36,C37,C41,C42,C43,C53,C54,C56,C58,C61,C68,C70,C71,C72,C77,C79,C81,C9,D1,D2,D6,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772084.1

438 aa

219

438

LRR_At1g61320_AtMIF1

LRR_At5g56370

PF23622 LRR_At1g61320_AtMIF1 105-239 aa PF24758 LRR_At5g56370 109-238 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772084.1`	Pfam	`PF23622`	LRR_At1g61320_AtMIF1	Repeat	105	239	8.9e-09	35.9	At1g61320/AtMIF1, LRR domain
`XP_057772084.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	109	238	2.6e-11	44.3	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916101.1
TTTCACCCTAGTGGGTTTTCTCTTCATTCCGAAAATCACTTTCATTTCTTGCGCTTTCAGAAAACAAAACAGAAAAATTACTTCATTTTCTTGTTCCTTTGGAGAGTGGAGTCCTTTTCTCTTTCCTTCCTCACAATGGCTTGCTCTCACTTTCCTCAGCTTCATGGTTACGAACATAACGAGGTTTCCGATAGCCTCGATCGACTGAGTGAGTTACCCGATTCCATAATCCTTTTAATTCTTTCGTTGTTGTCGTCGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991734
ATGGCTTGCTCTCACTTTCCTCAGCTTCATGGTTACGAACATAACGAGGTTTCCGATAGCCTCGATCGACTGAGTGAGTTACCCGATTCCATAATCCTTTTAATTCTTTCGTTGTTGTCGTCGACGAGAGATGCTGTTAGAACAACCATTCTGTCGAATCGCTGGAAAGATCTGTGGACCACCGTCCCCTGCCTTCACTTCGAAGAGGAAAATCCAGAGTTTATTTATGGGGTTGTTGCACGATGGAGAGGTGCCAAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772084.1
MACSHFPQLHGYEHNEVSDSLDRLSELPDSIILLILSLLSSTRDAVRTTILSNRWKDLWTTVPCLHFEEENPEFIYGVVARWRGAKIQRFYLLFLLDDDQVPCPTSSDLESWLHFAVEKQVEELYAYTHIPYCPPQSLYSCSSITTLHLQYCSLEIEGNVQLNQLVTLSVYIPDFSWVEVINKLLSGAPRLENMTLSAIASNLNFNIISLSLKTLIIENSEINGVLAISAPNLLTLRIGACIYNGANLLFHVPSLTEACF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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