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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000557`

染色体: Chr07 坐标: 3841007-3843718 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000557`
名称	SmilChr07G000557
描述	cullin-1-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	3841007 - 3843718 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991739`
GeneID	`130991739`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991739`
原始查询	`LOC130991739`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cullin-1-like
产物	cullin-1-like
Arabidopsis	`AT4G02570` (CUL1) cullin 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825648] identity=40.4; qcov=1.04; evalue=3.24e-58; confidence=medium
Rice	`Os01g0369000` (OsCUL1-1) - identity=42.4; qcov=1.04; evalue=1.29e-62; confidence=medium
GO	GO:0006511 (ubiquitin-dependent protein catabolic process); GO:0016567 (protein ubiquitination); GO:0031461 (cullin-RING ubiquitin ligase complex); GO:0031625 (ubiquitin protein ligase binding)
KEGG	-
Pfam	PF00888 (Cullin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991739

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057772095.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057772095.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772095.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772095.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772095.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:3841138`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	B3,B4,B54,C12,C15,C21,C42
`Chr7:3841142`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	B3,B4,B54,C12,C15,C21,C42
`Chr7:3841178`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B122,B30,B36,C59
`Chr7:3841330`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B70,C24,C28,C61
`Chr7:3841544`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B3,B4,B54,C15,C42
`Chr7:3841685`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B57,B91
`Chr7:3841711`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B72
`Chr7:3842127`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:3842183`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C72,D11
`Chr7:3842185`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B12,B55,B93,D10,D6
`Chr7:3842197`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr7:3842340`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B89

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772095.1

276 aa

138

276

Cullin

PF00888 Cullin 38-272 aa

XP_057772096.1

260 aa

130

260

Cullin

PF00888 Cullin 38-256 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772095.1`	Pfam	`PF00888`	Cullin	Repeat	38	272	6.4e-45	155.0	Cullin alpha solenoid domain
`XP_057772096.1`	Pfam	`PF00888`	Cullin	Repeat	38	256	3.6e-35	122.9	Cullin alpha solenoid domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916113.1
ATGTAGTCCGATGGCGCGTTTTGGTGGCACCGCAACCACTCAGCTCAGAAAGCCTCAGCAATTCTCATCTCCGCCGTGTCGCTGCCGAGCATGGCTGGTGGCGCCGCCGTGATGACGTTTGATGAAGCATGGCCTATTCTGCAGGAGGAAGCCATTAATAAGCTCATCGACTATCTGCAACCTGACGAGCCGTTCAACCGTCAAATTTTCACTTCTGCAGACTATATGCGATTATACACAGTTGTTTATAATGTAGCTTC...

XM_057916112.1
ATGTAGTCCGATGGCGCGTTTTGGTGGCACCGCAACCACTCAGCTCAGAAAGCCTCAGCAATTCTCATCTCCGCCGTGTCGCTGCCGAGCATGGCTGGTGGCGCCGCCGTGATGACGTTTGATGAAGCATGGCCTATTCTGCAGGAGGAAGCCATTAATAAGCTCATCGACTATCTGCAACCTGACGAGCCGTTCAACCGTCAAATTTTCACTTCTGCAGACTATATGCGATTATACACAGTTGTTTATAATGTAGCTTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130991739
ATGGCTGGTGGCGCCGCCGTGATGACGTTTGATGAAGCATGGCCTATTCTGCAGGAGGAAGCCATTAATAAGCTCATCGACTATCTGCAACCTGACGAGCCGTTCAACCGTCAAATTTTCACTTCTGCAGACTATATGCGATTATACACAGTTGTTTATAATGTAGCTTCTCCAATCCCATTAGGCCCTGAGGTCGACAAACTGTACAAGCAATACAAAAAAACATTTGAGGACTACATCTCTTCTGAGGTATTGCCGTC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057772095.1
MAGGAAVMTFDEAWPILQEEAINKLIDYLQPDEPFNRQIFTSADYMRLYTVVYNVASPIPLGPEVDKLYKQYKKTFEDYISSEVLPSLRGKESNDLLKELLRGWKNHKFMLLWLSRIFYYLSRYYISKKGLPSLAETSHSVFYDKVFGEIKDQVRDAVASFIEREREGEKTDQPLAKQVLSIFEEIGGDALENYENDIEEAMVEASAKFYSAKALDWMATMSYEEYMLKVEQCLEMEKSRVSEYLKLTNKNRVLEVVQHE...

XP_057772096.1
MAGGAAVMTFDEAWPILQEEAINKLIDYLQPDEPFNRQIFTSADYMRLYTVVYNVASPIPLGPEVDKLYKQYKKTFEDYISSEVLPSLRGKESNDLLKELLRGWKNHKFMLLWLSRIFYYLSRYYISKKGLPSLAETSHSVFYDKIEREREGEKTDQPLAKQVLSIFEEIGGDALENYENDIEEAMVEASAKFYSAKALDWMATMSYEEYMLKVEQCLEMEKSRVSEYLKLTNKNRVLEVVQHELLNVHAEQLEEKRASS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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