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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000584`

染色体: Chr07 坐标: 3983959-3991142 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000584`
名称	SmilChr07G000584
描述	uncharacterized SmilChr07G000584
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	3983959 - 3991142 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991756`
GeneID	`130991756`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991756`
原始查询	`LOC130991756`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	fanconi anemia group I-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834970]; symbol=AT5G49110; hit=AT5G49110; species=arabidopsis; confidence=high
产物	fanconi anemia group I-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834970]; symbol=AT5G49110; hit=AT5G49110; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G49110` (AT5G49110) fanconi anemia group I-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834970] identity=47.4; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0341200` - identity=47.4; qcov=0.12; evalue=3.97e-30; confidence=weak
GO	GO:0006281 (DNA repair); GO:0070182 (DNA polymerase binding)
KEGG	smil03460 (Fanconi anemia pathway - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF14675 (FANCI_S1); PF14676 (FANCI_S2); PF14678 (FANCI_S4); PF14679 (FANCI_HD1); PF14680 (FANCI_HD2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991756

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772120.1`
2	Chromosome	染色体	0.60000	`XP_057772120.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772120.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772120.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057772120.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:3984169`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B16,B57,B91
`Chr7:3984220`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B90,B92,C21
`Chr7:3984226`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B88
`Chr7:3984226`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B88
`Chr7:3984237`	`T`	`TCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	A20,A8,B2,B44,B89,C27,C57
`Chr7:3984301`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	83	A11,A13,A14,A16,A20,A21,A8,B103,B108,B109,B112,B113,B115,B118,B12,B120,B121,B123,B124,B129,B130,B131,B133,B135,B137,B14,B140,B18,B2,B21,B28,B29,B30,B37,B40,B42,B43,B47,B48,B49,B50,B51,B63,B64,B70,B71,B73,B79,B8,B82,B84,B85,B86,B89,B95,B97,C13,C15,C2,C22,C27,C3,C30,C33,C36,C41,C42,C44,C46,C48,C5,C57,C59,C60,C71,C72,C75,C76,C77,C84,C87,D5,D7
`Chr7:3984335`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B60,B77,C49,C6,C80
`Chr7:3984363`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B117,B72,C43,C83
`Chr7:3984385`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B86
`Chr7:3984386`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr7:3984418`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr7:3984545`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772120.1

1447 aa

724

1447

FANCI_S1

FANCI_HD1

FANCI_S2

FANCI_HD2

FANCI_S4

PF14675 FANCI_S1 103-270 aa PF14679 FANCI_HD1 297-378 aa PF14676 FANCI_S2 391-545 aa PF14680 FANCI_HD2 564-800 aa PF14678 FANCI_S4 1103-1341 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772120.1`	Pfam	`PF14675`	FANCI_S1	Repeat	103	270	1.4e-13	51.6	FANCI solenoid 1
`XP_057772120.1`	Pfam	`PF14679`	FANCI_HD1	Repeat	297	378	5.8e-21	74.9	FANCI helical domain 1
`XP_057772120.1`	Pfam	`PF14676`	FANCI_S2	Repeat	391	545	1.3e-45	156.1	FANCI solenoid 2
`XP_057772120.1`	Pfam	`PF14680`	FANCI_HD2	Repeat	564	800	2.1e-52	178.4	FANCI helical domain 2
`XP_057772120.1`	Pfam	`PF14678`	FANCI_S4	Repeat	1103	1341	3.8e-72	243.2	FANCI solenoid 4

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916137.1
GTACTACTGATTTTCACACATTTCCCCCCCAACTCTTCCCGCTCAAATCTAACGCCGCGCGTCGCCATGCGCTCGCCGGAAAGCTCCACCGGCGCTCTCCACTCTCCGCCGCAACCGCCACCACTGACAGACACCGAAATCATCTCACTCGCTCAACACCACCACCACCTCAATCCCGTTTCCTCCCAGCTCCCGCCTTTCCTTCTCGCCGAGTCATCACACCCAATTCTCCTCTCCTTTCTCCACTCACGCGCGGCCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991756
ATGCGCTCGCCGGAAAGCTCCACCGGCGCTCTCCACTCTCCGCCGCAACCGCCACCACTGACAGACACCGAAATCATCTCACTCGCTCAACACCACCACCACCTCAATCCCGTTTCCTCCCAGCTCCCGCCTTTCCTTCTCGCCGAGTCATCACACCCAATTCTCCTCTCCTTTCTCCACTCACGCGCGGCCGTGGCCGGCGACTCCTCCGCCGCAGTCTCCGACTACGTCTCCTCCCTCATTTCCCTCATCTCACACCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772120.1
MRSPESSTGALHSPPQPPPLTDTEIISLAQHHHHLNPVSSQLPPFLLAESSHPILLSFLHSRAAVAGDSSAAVSDYVSSLISLISHHPCAALSSLLPAVLHAYLSLFTSNKIPHDRNSLSIIQQFVGHLDTIEVKKIPEVVDVVISYFPQISDLDDAQVLILLPKCIELVRISSEIDKPVEYVSSVIDAVIECDWSNVLLIKMVEIVRDFASSIDKVRKRDFLQKIFGKMREDVEMQDLPGLVYQLLVLAAKGFGKREVI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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