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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003295`

染色体: Chr01 坐标: 51644312-51650026 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003295`
名称	SmilChr01G003295
描述	ABC transporter C family member 8-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	51644312 - 51650026 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991772`
GeneID	`130991772`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991772`
原始查询	`LOC130991772`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ABC transporter C family member 8-like
产物	ABC transporter C family member 8-like
Arabidopsis	`AT3G21250` (ABCC8) multidrug resistance-associated protein 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821679] identity=59.2; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0196100` (OsABCC14) - identity=57.7; qcov=0.865; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000325 (plant-type vacuole); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005774 (vacuolar membrane); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity); GO:0055085 (transmembrane transport); GO:0140359 (ABC-type transporter activity)
KEGG	-
Pfam	PF00005 (ABC_tran); PF00664 (ABC_membrane)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991772

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057772150.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	1.00000	`XP_057772150.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057772150.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772150.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772150.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:51644980`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,C28,C31
`Chr1:51645047`	`CTA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	A25,B44,B62,B78
`Chr1:51645047`	`CTA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	4	A25,B44,B62,B78
`Chr1:51645478`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,C8,D4
`Chr1:51645498`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,C8,D4
`Chr1:51645536`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B57,B59,C53,D9
`Chr1:51645637`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr1:51645854`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B67,B75
`Chr1:51646047`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr1:51646060`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15
`Chr1:51646062`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:51646086`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B106,B55,C25,C30,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772150.1

1459 aa

730

1459

ABC_membrane

ABC_tran

ABC_membrane

ABC_tran

PF00664 ABC_membrane 285-552 aa PF00005 ABC_tran 617-751 aa PF00664 ABC_membrane 900-1165 aa PF00005 ABC_tran 1233-1381 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772150.1`	Pfam	`PF00664`	ABC_membrane	Family	285	552	1.6e-45	156.7	ABC transporter transmembrane region
`XP_057772150.1`	Pfam	`PF00005`	ABC_tran	Domain	617	751	2e-49	168.4	ABC transporter
`XP_057772150.1`	Pfam	`PF00664`	ABC_membrane	Family	900	1165	1.6e-45	156.7	ABC transporter transmembrane region
`XP_057772150.1`	Pfam	`PF00005`	ABC_tran	Domain	1233	1381	2e-49	168.4	ABC transporter

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916167.1
CTCAAATTTTCTTCAGTTTAATTTCGACCATAATTTTTTTCCACAGTTTTCTACGCACCTCACACCTGCAATCAAATCAGTGGAAAGTAGCCAATTCTCATTTGTTCACTGCATATATTAAAATAGCCCTTCATCTACAATTTGTGATGTAAAAAAGAAAAACTTCAAAACAATGGCCTCCTCAATAGCTTTGTGGCGGGAAATTTCTTGGTTGCATGGAGAAATTATTGACAGGGGATTGTCTTCTTCTTTGAGAATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991772
ATGGCCTCCTCAATAGCTTTGTGGCGGGAAATTTCTTGGTTGCATGGAGAAATTATTGACAGGGGATTGTCTTCTTCTTTGAGAATCATCATTGATTACTTGAATCTATTGGTTGCCTTTGTCTTTTATGTGGTTTTACTTGTTATAAAGAGAAGTAGATTTAGAGAGAGAAGAAGAGATTGGTTTAACATAGCAATTTTAGGTGGCTGTGCTCTTGTGAGCATAGAATACTATGGGACTGCTATATATAGTGGTTTGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772150.1
MASSIALWREISWLHGEIIDRGLSSSLRIIIDYLNLLVAFVFYVVLLVIKRSRFRERRRDWFNIAILGGCALVSIEYYGTAIYSGLISKGEESSRFSWLVCFGRGLIWTTLAISVIVRGPRLVAVLKSAWWIVFFLLISALNILDLVKSGHIQILEIAPWLVNLLLLFCGLRNLRGIVSQPVLDSSFSESILVKTSEKDCVDLDEASLLSILLFSWINPLLRLGHSRTLNLNDVPSLGSEDEALLAYKNFGDAWSALKEE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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