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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000640`

染色体: Chr07 坐标: 4312094-4315919 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000640`
名称	SmilChr07G000640
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	4312094 - 4315919 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991778`
GeneID	`130991778`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991778`
原始查询	`LOC130991778`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
Arabidopsis	`AT3G46530` (RPP13) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823806] identity=33.8; qcov=0.699; evalue=1.51e-76; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=31.3; qcov=0.989; evalue=1.18e-87; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991778

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057772154.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057772154.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057772154.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772154.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772154.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:4312920`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr7:4312922`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C46
`Chr7:4312922`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C46
`Chr7:4312937`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr7:4312966`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B74,C2,C60
`Chr7:4313127`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105
`Chr7:4313159`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr7:4313176`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr7:4313222`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	173	A1,A11,A13,A16,A18,A19,A21,A22,A23,A24,A25,A3,A7,A9,B10,B101,B104,B105,B106,B107,B109,B110,B112,B113,B114,B115,B120,B121,B123,B124,B125,B126,B127,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B134,B135,B136,B139,B140,B15,B16,B17,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B26,B29,B3,B30,B31,B32,B33,B34,B36,B37,B41,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B50,B51,B53,B54,B55,B56,B57,B59,B60,B61,B62,B64,B65,B66,B69,B7,B70,B72,B73,B74,B76,B78,B80,B82,B86,B87,B88,B9,B90,B92,B93,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C13,C14,C15,C16,C17,C19,C20,C21,C22,C24,C25,C26,C28,C3,C30,C31,C32,C34,C35,C36,C37,C39,C41,C42,C43,C44,C45,C47,C49,C5,C50,C52,C53,C54,C55,C56,C59,C61,C62,C64,C66,C68,C69,C7,C70,C71,C73,C75,C76,C77,C78,C8,C80,C85,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D4,D5,D6,D7
`Chr7:4313243`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105
`Chr7:4313252`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr7:4313294`	`CTA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	11	A15,A20,B117,B125,B18,B28,B55,B69,C81,C84,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772154.1

845 aa

422

845

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF00931 NB-ARC 145-318 aa PF23559 WHD_DRP 400-470 aa PF23598 LRR_14 534-820 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772154.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	145	318	1.4e-42	145.9	NB-ARC domain
`XP_057772154.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	400	470	3.6e-22	78.9	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057772154.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	534	820	7.3e-15	55.3	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916171.1
AAATTAAACAATAATAAATTTTGGAGGAGATCGATAAAATTAATGGAATCCGAAAAATTGCAAGGTATCATCACCTAAATAAAATAATAAACCCCCATTTCTCTTGGGCAGTGCATCAATTGTACATTATTAATATTTCAAATTTCAATAGACCTCGAACACTTGTTTCAAAATCGTAATGGTTGCTTCATGTAAAATAATGCAAATCCTGCAAGAATATTCAAGCAGACCACAATCCTTCTTCATTATATAGTGTATCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991778
ATGGCTTACAATCTTCAACCTCTCATCACCATCCTACAACAAATCTTAAACCCTGAACAATCACACTGGCTTCTTGATCACAACAAACCAAGTCTAGAATCCCTTCTTCAAAAAGCTGCTTCTCTTCAACCGATTCTTGAAAAATCTTCACTCACCAGCATAAAAAGTTTGGAGAACCAAATCAGAGATGCAACACATAAAGCAGAAGATATCATTGAATCTCAAATGGTTGATCAAATGCTTTCCAGCCCCGAAGGCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772154.1
MAYNLQPLITILQQILNPEQSHWLLDHNKPSLESLLQKAASLQPILEKSSLTSIKSLENQIRDATHKAEDIIESQMVDQMLSSPEGVSFTFSTPDLQQVSQQLDSIMEQVEKLAEGNTMSGGSSSSGASLSQDPSSKSVVVGVDEDLMQLKDRLTGMQTKLEILPIVGMGGIGKTTLARKLYENTDIVSHFEYARAWTTISQDYNMRAILLGLLRCIIGKECDQHNEKGDGELKDILYRSLYGRRYMVVLDDIWSTKFWD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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