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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000716`

染色体: Chr07 坐标: 4976890-4985229 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000716`
名称	SmilChr07G000716
描述	DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 13
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	4976890 - 4985229 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991782`
GeneID	`130991782`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991782`
原始查询	`LOC130991782`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 13
产物	DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 13
Arabidopsis	`AT3G16840` (AT3G16840) P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820937] identity=62.2; qcov=0.772; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0510400` (OsRH13) - identity=61.1; qcov=0.803; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0003724 (RNA helicase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005730 (nucleolus)
KEGG	-
Pfam	PF00270 (DEAD); PF00271 (Helicase_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991782

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772159.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057772159.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772159.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772159.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772159.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:4977388`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr7:4977417`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr7:4977418`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B104,B34,C38,C51
`Chr7:4977658`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B136,C55,C77
`Chr7:4978867`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B38,B5,C17,D10
`Chr7:4979415`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C26
`Chr7:4979698`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr7:4980599`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B89
`Chr7:4980979`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:4980980`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B38,B39,B5,C17,D10
`Chr7:4981030`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr7:4981122`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C26

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772159.1

819 aa

410

819

DEAD

Helicase_C

PF00270 DEAD 211-419 aa PF00271 Helicase_C 483-590 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772159.1`	Pfam	`PF00270`	DEAD	Domain	211	419	2.6e-38	132.1	DEAD/DEAH box helicase
`XP_057772159.1`	Pfam	`PF00271`	Helicase_C	Domain	483	590	3.4e-30	105.2	Helicase conserved C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916176.1
AAAATCGAACTCATCAACCCTCAACATTTCTGCGGCAAACAGCAATCGAATTTCACTAACAGGAAAACGTTCTCATTTTTTCCCTCAAACTGTTTCGATTTCAGCTCTCACAGTGCAAGAATGGCGTCGGAGTCTGCCGAGAGGAAGAAAGCTTATCGGAAGTCCAGGAAGCGAGCTCGAGGCGAGATGGACCAGCAGCTCGAACGGTTGGAGTCGCTGCCGTGGAGCTCCTCGCTTCCAGCGAGTAATGGCGGCGCTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991782
ATGGCGTCGGAGTCTGCCGAGAGGAAGAAAGCTTATCGGAAGTCCAGGAAGCGAGCTCGAGGCGAGATGGACCAGCAGCTCGAACGGTTGGAGTCGCTGCCGTGGAGCTCCTCGCTTCCAGCGAGTAATGGCGGCGCTGACGATGATCTCTCTCTTTTCATCGGCTCTAACGAACTTGAAGGAGGATTTCTTACTCTTGAAGAGATTGATGAAGCAGAGTATGGGTTGGAAATTCCCAATGTCAAGGTTGAAACTGAGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772159.1
MASESAERKKAYRKSRKRARGEMDQQLERLESLPWSSSLPASNGGADDDLSLFIGSNELEGGFLTLEEIDEAEYGLEIPNVKVETERKKLKGKKESKRSELNEGGADERLDAELYGECKDKDEESKEDNEKKQKKKKKKKEGKKKKKDIQKNDETDKAQENSETTTASDAKEGCNVEEELIDEDEYYAWNELRLHPMIMKSIYRLKFKEPTPIQKACIPAAAHQGKDVIGAAETGSGKTLAFGLPILQRLLEEREKVERL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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