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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000611`

染色体: Chr07 坐标: 4155322-4158576 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000611`
名称	SmilChr07G000611
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	4155322 - 4158576 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991788`
GeneID	`130991788`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991788`
原始查询	`LOC130991788`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
Arabidopsis	`AT5G35450` (AT5G35450) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833508] identity=30.1; qcov=1.02; evalue=8.56e-71; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=33.9; qcov=0.991; evalue=6.7e-85; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991788

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057772170.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057772170.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772170.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772170.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772170.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:4155530`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A23
`Chr7:4155530`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A23
`Chr7:4155555`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B122,B56,C23,C56
`Chr7:4155558`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A13,B139,B5,C4,C63
`Chr7:4155558`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,B139,B5,C4,C63
`Chr7:4155572`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C7
`Chr7:4155573`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C7
`Chr7:4155716`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B115,B68,C25,C3,C83
`Chr7:4155727`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C21,C32,C68
`Chr7:4155800`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B115,B77,B81,B82,C50
`Chr7:4155808`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	19	B105,B114,B123,B126,B138,B14,B38,B58,B74,B80,B89,B90,C29,C33,C44,C61,C63,C75,D5
`Chr7:4155811`	`CAG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	21	B105,B114,B123,B126,B138,B14,B38,B55,B58,B74,B80,B89,B90,C20,C29,C33,C44,C61,C63,C75,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772170.1

653 aa

326

653

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF00931 NB-ARC 146-318 aa PF23559 WHD_DRP 402-471 aa PF23598 LRR_14 534-644 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772170.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	146	318	2.5e-43	148.4	NB-ARC domain
`XP_057772170.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	402	471	6.3e-20	71.7	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057772170.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	534	644	8.8e-11	41.9	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916187.1
CTCCTCATTGTTGTGATAGCTACAAATAACAATTTTATTTTATTTGATCAAGGTCAATACTACACCTGCCTAGCTATACAGATTGGATCATTGTTGTGATAGCTACTAATTTTCCCATCCTTTGTGAGTGAAAAGAGATCAGAAAAATGGCTTACAATCTTCAACCCCTCATCACCATCCTACAACAAATCTTGAATCCTGAACAATCATGCTGGATTGTTGATCACAACAAACCACAACTCGAATCCCTCCTCCAAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991788
ATGGCTTACAATCTTCAACCCCTCATCACCATCCTACAACAAATCTTGAATCCTGAACAATCATGCTGGATTGTTGATCACAACAAACCACAACTCGAATCCCTCCTCCAAAAAGCTGCTTATCTGCAGCAGATCCTTGAAAAATCTTCACTCCCCAAAAACATAGAAAACTTGGAAAGTCAAATCAGAGATGCAGCACATAGAGCAGAAGATATCATTGAATCTCAGATGGTTGATCAAATTCTTTCCAGCCCCGAAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772170.1
MAYNLQPLITILQQILNPEQSCWIVDHNKPQLESLLQKAAYLQQILEKSSLPKNIENLESQIRDAAHRAEDIIESQMVDQILSSPEGERFTFSTPDLQQVMQLLDSAMEQVVKLAEEKTMPSGSSSSGASLLQDPSLKSVVVGVDEDLMQLKDRLTGMQSKLEIVPIVGMGGIGKTTLARKLYDDPSIVMHFEYARAWATISQDYNMKAILLSLLRCIIGKECDQHNEKGDGELKDILYRSLYGRRYMIVLDDIWSTKFW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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