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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000604`

染色体: Chr07 坐标: 4125019-4127507 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000604`
名称	SmilChr07G000604
描述	uncharacterized SmilChr07G000604
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	4125019 - 4127507 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991800`
GeneID	`130991800`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991800`
原始查询	`LOC130991800`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ABC subfamily C protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827263]; symbol=AT4G15820; hit=AT4G15820; species=arabidopsis; confidence=low
产物	ABC subfamily C protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827263]; symbol=AT4G15820; hit=AT4G15820; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G15820` (AT4G15820) ABC subfamily C protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827263] identity=34.7; qcov=0.796; evalue=8.66e-51; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF11360 (DUF3110)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991800

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057772187.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.60000	`XP_057772187.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057772187.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772187.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772187.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:4125313`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,B4
`Chr7:4125336`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C7
`Chr7:4125487`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr7:4125521`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr7:4125523`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B49,B79,B81
`Chr7:4125557`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B87,D6
`Chr7:4125560`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr7:4125598`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B86
`Chr7:4125607`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B119,B32,B48,C78
`Chr7:4125626`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr7:4125719`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B37,B78,B82,C85
`Chr7:4125752`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	9	B140,B37,B78,B82,C2,C55,C60,C85,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772187.1

572 aa

286

572

DUF3110

PF11360 DUF3110 463-550 aa

XP_057772188.1

568 aa

284

568

DUF3110

PF11360 DUF3110 459-546 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772187.1`	Pfam	`PF11360`	DUF3110	Domain	463	550	3.7e-07	31.0	Domain of unknown function (DUF3110)
`XP_057772188.1`	Pfam	`PF11360`	DUF3110	Domain	459	546	3.7e-07	31.0	Domain of unknown function (DUF3110)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916205.1
ACGCTTTACACAAATATTTCCATCTAAATAATGGTTACTGTCGGTATTCCCATGGCAAAATGGCGGCTATGCACCATGGTGCCACCGCCGCCGCCACCGCCCTCCACCGCCGTCGATTCACGCACGAGAATATCAGTCTCGTGAAACCAGTTTTCTTCGTTTACAGCTCTTCCGCTTCGTTCCCATCTAAACAAGCCCGAAGAAGAAACCATCTCCGCCAAAAAATCCTCAAAACCCTTAAAAATCCCATTATCCCCAAA...

XM_057916204.1
AATGGTTACTGTCGGTATTCCCATGGCAAAATGGCGGCTATGCACCATGGTGCCACCGCCGCCGCCACCGCCCTCCACCGCCGTCGATTCACGCACGAGAATATCAGTCTCGTGAAACCAGTTTTCTTCGTTTACAGCTCTTCCGCTTCGTTCCCATCTAAACAAGCCCGAAGAAGAAACCATCTCCGCCAAAAAATCCTCAAAACCCTTAAAAATCCCATTATCCCCAAATTACCGCCTGCAAACCCGATAGTCCCCGT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130991800
ATGGCGGCTATGCACCATGGTGCCACCGCCGCCGCCACCGCCCTCCACCGCCGTCGATTCACGCACGAGAATATCAGTCTCGTGAAACCAGTTTTCTTCGTTTACAGCTCTTCCGCTTCGTTCCCATCTAAACAAGCCCGAAGAAGAAACCATCTCCGCCAAAAAATCCTCAAAACCCTTAAAAATCCCATTATCCCCAAATTACCGCCTGCAAACCCGATAGTCCCCGTTGAACCCCCACCTCAAGAGATCGATTTGAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057772187.1
MAAMHHGATAAATALHRRRFTHENISLVKPVFFVYSSSASFPSKQARRRNHLRQKILKTLKNPIIPKLPPANPIVPVEPPPQEIDLNQEIKEFEKSENEEARELQELKEAEVSPPAGVGIDGGIGLAGKDSILKYGWWFVGAFVFQTVCAVLFVGLDDTDNKREIVNGSGELRAVLDETASVKTGLRDSVIGDGNVNVEKLEMERKIEEIRIMAREAREKERLQSNRNGNDGEDGEDDEGSDGGKIVKSGIAEEVDCTMV...

XP_057772188.1
MAAMHHGATAAATALHRRRFTHENISLVKPVFFVYSSSASFPSKQARRRNHLRQKILKTLKNPIIPKLPPANPIVPVEPPPQEIDLNQEIKEFEKSENEEARELQELKEAEVSPPAGVGIDGGIGLAGKDSILKYGWWFVGAFVFQTVCAVLFVGLDDTDNKREIVNGSGELRAVLDETASVKTGLRDSVIGDGNVNVEKLEMERKIEEIRIMAREAREKERLQSNRNGNDGEDGEDDEGSDGGKIVKSGIAEEVDCTMV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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