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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000730`

染色体: Chr07 坐标: 5083408-5089309 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000730`
名称	SmilChr07G000730
描述	germacrene A synthase-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	5083408 - 5089309 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991809`
GeneID	`130991809`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991809`
原始查询	`LOC130991809`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	germacrene A synthase-like
产物	germacrene A synthase-like
Arabidopsis	`AT5G23960` (TPS21) terpene synthase 21 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832461] identity=39; qcov=0.989; evalue=4.92e-135; confidence=medium
Rice	`Os08g0139700` (OsTPS29) - identity=37.1; qcov=0.98; evalue=6.89e-113; confidence=medium
GO	GO:0000287 (magnesium ion binding); GO:0010333 (terpene synthase activity); GO:0016102 (diterpenoid biosynthetic process)
KEGG	-
Pfam	PF01397 (Terpene_synth); PF03936 (Terpene_synth_C); PF19086 (Terpene_syn_C_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991809

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057772198.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057772198.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772198.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772198.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772198.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:5083697`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr7:5083743`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr7:5083790`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B140,B38,B39,B65,B69
`Chr7:5083794`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B89,C37
`Chr7:5083840`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B72,C43,C55
`Chr7:5083850`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B60,C3
`Chr7:5083874`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:5083953`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B19,C81,D9
`Chr7:5083957`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C36
`Chr7:5083957`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C36
`Chr7:5084101`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B60,C3
`Chr7:5084112`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B72,C43,C55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772198.1

550 aa

275

550

Terpene_synth

Terpene_synth_C

Terpene_syn_C_2

PF01397 Terpene_synth 21-196 aa PF03936 Terpene_synth_C 253-491 aa PF19086 Terpene_syn_C_2 295-491 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772198.1`	Pfam	`PF01397`	Terpene_synth	Repeat	21	196	1.5e-53	182.1	Terpene synthase, N-terminal domain
`XP_057772198.1`	Pfam	`PF03936`	Terpene_synth_C	Domain	253	491	1.3e-91	306.9	Terpene synthase family, metal binding domain
`XP_057772198.1`	Pfam	`PF19086`	Terpene_syn_C_2	Domain	295	491	4.9e-49	167.5	Terpene synthase family 2, C-terminal metal binding

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916215.1
GTTAACGTCATACTCTCTTATACTCTGATGAGGTCTTTTAAAGAGATGATAGCCCCCCTTCGTTTCCTATAAAATCATTAAGCCAGGGATTGTTTTACATTGATGCATTTATTACATTAATCGTTTGTTGTGCTAATATATTTTGGATATTATATTAATACTTCTTCTATATAGTATTAGTAGTATAAATTATTTGACGAACCCGTGCCTACATATACGTGTGGTTTATTCTCTAATTAATAACACCACAAACTAATTAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991809
ATGGCGGCTCTAAACTCTAACAGTTTCTATCATCGTCCTGAGACAAATTTCTCCCCCAGCTTGTGGGGTGATCACTTCATTAATCACATTTCCGACTCCGAGGTGAAGGAAAAGTATTCCAAACAAGTTGAAATATTAAAAAATGTTGCTAGAAGTCTGCTAACAGCTCCAGAAGCCAAAATGATAGACAGCATGAATCTGATCGACACACTTGAGCGCCTAGGCGTCTCCTATCACTTTGAAAACGAGATTGAACAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772198.1
MAALNSNSFYHRPETNFSPSLWGDHFINHISDSEVKEKYSKQVEILKNVARSLLTAPEAKMIDSMNLIDTLERLGVSYHFENEIEQKLQQFFHLNMNYKDDEAYDLYTVALHFRLFRQHGHPISTEIFSKWMDVKGKFQEGIKSDPKGMLSLYEASYLRTSGETILDDALAFTTATLKSMTPSLGSPLKQQVVHALVQPLHLGFPRVEAHSFISIYEEEEHKNETLIEFAKLDYNILQMLHKEELRQVSRWWKELGLISK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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