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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000614`

染色体: Chr07 坐标: 4167917-4174223 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000614`
名称	SmilChr07G000614
描述	probable histone-arginine methyltransferase 1.3
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	4167917 - 4174223 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991824`
GeneID	`130991824`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991824`
原始查询	`LOC130991824`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable histone-arginine methyltransferase 1.3
产物	probable histone-arginine methyltransferase 1.3
Arabidopsis	`AT5G49020` (PRMT4A) protein arginine methyltransferase 4A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834961] identity=71.1; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0671700` (OsPRMT4) - identity=75.9; qcov=0.879; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016274 (protein-arginine N-methyltransferase activity); GO:0018216 (peptidyl-arginine methylation)
KEGG	-
Pfam	PF06325 (PrmA); PF08241 (Methyltransf_11); PF13649 (Methyltransf_25); PF22528 (PRMT_C); PF25350 (PH_PRMT_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991824

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057772215.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057772215.1`
3	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057772215.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057772215.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772215.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:4168686`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr7:4168695`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B17,B66
`Chr7:4171658`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:4172538`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr7:4173727`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B101,B81
`Chr7:4173769`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B29,C15,C4,C7
`Chr7:4173790`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772215.1

519 aa

260

519

PH_PRMT_N

PrmA

Methyltransf_25

Methyltransf_11

PRMT_C

PF25350 PH_PRMT_N 8-108 aa PF06325 PrmA 176-249 aa PF13649 Methyltransf_25 180-275 aa PF08241 Methyltransf_11 181-250 aa PF22528 PRMT_C 285-449 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772215.1`	Pfam	`PF25350`	PH_PRMT_N	Domain	8	108	3.2e-42	143.7	Protein arginine methyltransferase N-terminal PH domain
`XP_057772215.1`	Pfam	`PF06325`	PrmA	Family	176	249	8e-08	32.8	Ribosomal protein L11 methyltransferase (PrmA)
`XP_057772215.1`	Pfam	`PF13649`	Methyltransf_25	Domain	180	275	1.7e-06	29.3	Methyltransferase domain
`XP_057772215.1`	Pfam	`PF08241`	Methyltransf_11	Domain	181	250	0.00012	23.3	Methyltransferase domain
`XP_057772215.1`	Pfam	`PF22528`	PRMT_C	Domain	285	449	1.9e-21	77.4	Arginine methyltransferase oligomerization subdomain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916232.1
CTTTCGTACTTGTGTCATCTCTCACTCTCGAATCCAAAAGAAACTAAGCAACCAAACAAGTACAACCACTCCCACCAATCCCAGGTCGACACGTCACCGGTTGCACCGCGGCGCACTCTCCCCTGCAGCAGGGGATCACGGGGACCCCTCATCATCAACGCCTCCAAACAAAAACCAGTGCAGCAAAAAGCCATTGCGCACTAAAACCTCCCCCCCACTCTCTCAGTGAAAACCCTAACTGTTTCTCTTTCTGGACGCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991824
ATGGAGAACAATAAGCTGAGGGAGCAGGACTTTTTGGTAGCCTCAATCTCGCAGCTGTCGATTTCCGGCAGCGCCTCGGCGCCGGTGGTGGCGCGCTTCCGCTCCGACTCGCTTTTATTCGGCTCCGAGTCCGATTCGGACGACGCGGTTCAGTTCAATCTCAGCAACTGCCAGCTTTTCAAGCTTGGTCCAGCTCAATCATTGTGTATGTCTGAAGCTTCTGATACAAATAAGGAGAAAAGCTATTCCAGGGGAATCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772215.1
MENNKLREQDFLVASISQLSISGSASAPVVARFRSDSLLFGSESDSDDAVQFNLSNCQLFKLGPAQSLCMSEASDTNKEKSYSRGITIEFRNEEESKAFHCAFEQWKKEMVVQGSSLPNGIVSSSASKFDDKIEASSAKMYFHYYGQLLHQQNMLQDYVRTGSYYAAVLENRNDFADRVVVDVGAGSGILSLFAAQAGAKHVYAVEASDMADYARKLISGNPSLSERITVIKGKVEEVELPEKADILISEPMGTLLVNER...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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