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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003303`

染色体: Chr01 坐标: 51711980-51719063 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003303`
名称	SmilChr01G003303
描述	serine/threonine protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	51711980 - 51719063 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991833`
GeneID	`130991833`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991833`
原始查询	`LOC130991833`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine/threonine protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform-like
产物	serine/threonine protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform-like
Arabidopsis	`AT1G17720` (ATB BETA) Protein phosphatase 2A, regulatory subunit PR55 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838348] identity=83.6; qcov=0.987; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0224200` - identity=81.7; qcov=0.96; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000159 (protein phosphatase type 2A complex); GO:0005515 (protein binding); GO:0005829 (cytosol); GO:0019888 (protein phosphatase regulator activity); GO:0070262 (peptidyl-serine dephosphorylation)
KEGG	smil03015 (mRNA surveillance pathway - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04382 (Cornified envelope formation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00400 (WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991833

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772230.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057772230.1`
3	Nuclear body	核内小体	0.40000	`XP_057772230.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057772230.1`
5	Vesicle	囊泡	0.20000	`XP_057772230.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:51712699`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr1:51712837`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr1:51712962`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr1:51712965`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:51713161`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B129,B94,C59,C80
`Chr1:51714693`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,B77
`Chr1:51716876`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C73,D11
`Chr1:51717033`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:51718539`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772230.1

519 aa

260

519

WD40

PF00400 WD40 231-266 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772230.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	231	266	3.2e-16	59.8	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916247.1
GAGATAGAAATATATGTATTTGATAATCGATATAGGCTTTTTAGACAGAGAAAGGGGGAGGAAGAAAGAAAGCAGAGAGTGCCTCTGTGAATAAAAGAAAAACGGTAAATTATAGAAAGAGGAAAAACATTTTCCCACTCTCTATACGTACAAATCAATATATCTACACATAGAGAGAGAAAATCTGAATCCTCGTTTCTGTTTTGTACTAATCGATGTTGTATTTGTATATACACACTCCGGCGAAAAATGTTCGAATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991833
ATGGACGGTGGTGGTGGCGGTGGTGGAGAGGTGGCATCAGCTGCGGCGGGTCCACCTGCGCCGCTCGACTGGAAATTCTCTCAGGTCTTCGGCGAGAGGACGGCCGGCGAAGAAGTACAAGAAGTTGATATCATCTCAGCAATTGAGTTCGATAAAACTGGCGACCATCTAGCCACTGGTGACCGTGGTGGAAGGGTTGTGTTATTTGAAAGGACTGATTCGAAAGAGCATGGTCGGAATCGTAGAGACTTAGAGAGGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772230.1
MDGGGGGGGEVASAAAGPPAPLDWKFSQVFGERTAGEEVQEVDIISAIEFDKTGDHLATGDRGGRVVLFERTDSKEHGRNRRDLERMDYSVGRHPEFRYKTEFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIRWCQAANGALFLLSTNDKTIKFWKVQEKKVKKISDMNADTFKGAGNGSVASSSVSSGLKQCLANGSYSDRSNNSLSNDLSFPPGGIPSLRLPVITSSETNLVARCRRVYAHAHDYHINSISNNSDGETFISADDL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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