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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000777`

染色体: Chr07 坐标: 5472486-5476602 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000777`
名称	SmilChr07G000777
描述	protein ALP1-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	5472486 - 5476602 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991859`
GeneID	`130991859`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991859`
原始查询	`LOC130991859`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ALP1-like
产物	protein ALP1-like
Arabidopsis	`AT3G55350` (AT3G55350) PIF / Ping-Pong family of plant transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824701] identity=51.5; qcov=0.915; evalue=4.57e-132; confidence=high
Rice	`Os11g0702700` - identity=52.3; qcov=0.903; evalue=2.1e-135; confidence=high
GO	GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991859

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772258.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057772258.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772258.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772258.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772258.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:5473165`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr7:5475342`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C63
`Chr7:5475343`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,D8
`Chr7:5475369`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,D8
`Chr7:5475456`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,C82
`Chr7:5475534`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr7:5475586`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,C38,C51,C77
`Chr7:5475609`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,C63
`Chr7:5475676`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B89
`Chr7:5475816`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:5475864`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C83,D6
`Chr7:5475895`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772258.1

390 aa

195

390

Plant_tran

DDE_Tnp_4

PF04827 Plant_tran 154-349 aa PF13359 DDE_Tnp_4 174-340 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772258.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	154	349	9.6e-14	52.2	Plant transposon protein
`XP_057772258.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	174	340	1e-29	104.0	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916275.1
TTAGGCCGATATATTATACTCCTAACAATCATAGCGAGCTACCCTCTCTCTCTCCTCTCTCTGTCTCTCTCGGCTCACAACCCATAGTGATGGCGCCTTTGAGAGGTAGAAAGAAGAGGAGAGTTGAGAATCAAGATGAAGATAATAAATCTTTGGCTTCTTCTGGGTCTTCTTCTCGAGAGGGTTTTGGTGAATGGTGGGATATTTTGTGCAAGAAAATTGCGGGCAATCCATCGACTTCGCGGGCATTGGATCCCTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991859
ATGGCGCCTTTGAGAGGTAGAAAGAAGAGGAGAGTTGAGAATCAAGATGAAGATAATAAATCTTTGGCTTCTTCTGGGTCTTCTTCTCGAGAGGGTTTTGGTGAATGGTGGGATATTTTGTGCAAGAAAATTGCGGGCAATCCATCGACTTCGCGGGCATTGGATCCCTTCAAATTGAGTTTCGCGATGTCGAGAAAAACATTCAACTACATATGCTCATTAGTGAAGGAGCACATGATGTCTAAAACACATTTCACCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772258.1
MAPLRGRKKRRVENQDEDNKSLASSGSSSREGFGEWWDILCKKIAGNPSTSRALDPFKLSFAMSRKTFNYICSLVKEHMMSKTHFTFSNGKPMSLDDQVALALTRLGSGNSLISIGDSFGAHHSTVSQATWRFVEAIEDKGIHHLRWPSTEEELSKIKCKFEKIRGLPNCCGAIDTTHITMLLTSSDPEADCWLDCRGKHSMILQAVVDPDLKFLNINAGWPGKMNDSSVLQSSSLFRQCQRGEMLNGPKMLVSDKMELR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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