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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000594`

染色体: Chr07 坐标: 4056473-4060002 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000594`
名称	SmilChr07G000594
描述	chaperone protein dnaJ 49
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	4056473 - 4060002 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991867`
GeneID	`130991867`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991867`
原始查询	`LOC130991867`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chaperone protein dnaJ 49
产物	chaperone protein dnaJ 49
Arabidopsis	`AT5G49060` (AT5G49060) DnaJ heat shock amino-terminal domain protein (DUF1977) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834965] identity=56.2; qcov=0.997; evalue=1.68e-121; confidence=high
Rice	`Os05g0364500` (OsDjC48) - identity=49.3; qcov=1.04; evalue=7.58e-117; confidence=high
GO	GO:0005789 (endoplasmic reticulum membrane); GO:0030433 (GO:0030433); GO:0030544 (Hsp70 protein binding); GO:0051085 (GO:0051085); GO:0071218 (cellular response to misfolded protein)
KEGG	smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00226 (DnaJ); PF09320 (DUF1977)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991867

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057772271.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057772271.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772271.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772271.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772271.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:4058474`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:4058606`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:4058779`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B127,C26,C79
`Chr7:4058855`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:4059057`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A6
`Chr7:4059057`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A6
`Chr7:4059060`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6
`Chr7:4059105`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B45,B83,C59
`Chr7:4059226`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	18	A13,A7,A9,B114,B12,B121,B134,B24,B32,B4,B76,B87,B99,C20,C70,C87,C9,D9
`Chr7:4059248`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B45,B83,C59
`Chr7:4059286`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr7:4059352`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772271.1

353 aa

176

353

DnaJ

DUF1977

PF00226 DnaJ 107-168 aa PF09320 DUF1977 265-335 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772271.1`	Pfam	`PF00226`	DnaJ	Domain	107	168	3.3e-25	88.7	DnaJ domain
`XP_057772271.1`	Pfam	`PF09320`	DUF1977	Family	265	335	2.6e-09	37.9	Domain of unknown function (DUF1977)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916288.1
AAGACAAATGGAAAATCAATGTGTGCAAATTGACTTGTCACATTTCAATTGGTTGACAATTAGGGCACTATATATTTGCACCTATACATATTCCTCTCGTGTCATCTCACTCTTGCTCTTTCTCTCTCTACGAGTCGGACCAGTCGGTCATGGGATTACGGATCTAATACTTATAGTTAGGGGAAATTGTGGTATTTTGGGTGATCGACGGTGAACTTGATGCAGTAGGGTGTGGATGAATTTCTGAATTGATGATTTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991867
ATGGATAGCAACAAAGATGAGGCGTTGAGATGTATAAACATTGCGAAAGAGGCAATTGCAGCAGGTAATAAGCAAAGAGCCGTGAAATTTATTGGCATTGCTCGCCGCCTTAACCAGAGTTTATCCGTGGATGATCTCTTGGCCGCTTGTGAGAATCTCGATTCCTCGTCTTCTGCCGGCCCATCTAGTAATGTGAAGAAGGCTTCCACGGTGAAGACCGATCAGGGTGCTGCCGCAAATTCTGATGGGATTTCAAACGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772271.1
MDSNKDEALRCINIAKEAIAAGNKQRAVKFIGIARRLNQSLSVDDLLAACENLDSSSSAGPSSNVKKASTVKTDQGAAANSDGISNGERNYTDEHVLLVRQIKTKKDYYAILGVEKSCSVEEIRKAYRKLSLKVHPDKNKAPGSEEAFKKVSKAFKCLSEDESRRQYDQTGLVDEFEHNQQYQTRRRRRRTGNDFFDDEFDPDEIFRAFFGQRDAFRNAHVYRTRTHTAAAHQREDLGNTGPSLMLLLQLLPFLIIILLA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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