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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000731`

染色体: Chr07 坐标: 5103409-5105336 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000731`
名称	SmilChr07G000731
描述	(-)-5-epieremophilene synthase STPS3-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	5103409 - 5105336 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991899`
GeneID	`130991899`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991899`
原始查询	`LOC130991899`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	(-)-5-epieremophilene synthase STPS3-like
产物	(-)-5-epieremophilene synthase STPS3-like
Arabidopsis	`AT5G23960` (TPS21) terpene synthase 21 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832461] identity=44.4; qcov=0.984; evalue=2.19e-52; confidence=medium
Rice	`Os08g0167800` (TPS) - identity=45.8; qcov=0.99; evalue=3.33e-56; confidence=high
GO	GO:0000287 (magnesium ion binding); GO:0010333 (terpene synthase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01397 (Terpene_synth); PF03936 (Terpene_synth_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991899

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057772335.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057772335.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.40000	`XP_057772335.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772335.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772335.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:5103582`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	1	C85
`Chr7:5103582`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C85
`Chr7:5103585`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	20	A3,B115,B125,B20,B24,B28,B33,B38,B39,B5,B53,B64,B66,B67,B80,B85,B94,C17,C65,D5
`Chr7:5103590`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,C26
`Chr7:5103639`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,C26,C63
`Chr7:5103643`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr7:5103665`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B58,C28,C33,C46
`Chr7:5103665`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B58,C28,C33,C46
`Chr7:5103669`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B36,B87,B90,C21
`Chr7:5103695`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	C36,C53
`Chr7:5103695`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	C36,C53
`Chr7:5103698`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C36,C53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772335.1

192 aa

192

Terpene_synth

Terpene_synth_C

PF01397 Terpene_synth 2-65 aa PF03936 Terpene_synth_C 122-190 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772335.1`	Pfam	`PF01397`	Terpene_synth	Repeat	2	65	4.1e-17	63.2	Terpene synthase, N-terminal domain
`XP_057772335.1`	Pfam	`PF03936`	Terpene_synth_C	Domain	122	190	3.8e-30	105.7	Terpene synthase family, metal binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916352.1
GGGCGAGGCAACGTTCTTTGGGGAAGGATGGAACAGCCAGCTCCCAGCCCTATTGAACTGATTTTAAGTCCTCATCTTTGGACCTGTGCTGTTTGTTGCTGGATAATTGGCCATTCCACCGGTTAGATCATCATATTAAATATTTAGTAAATGGATGGATGTGGAAGGGAAATTCCAAGAGAGCATTAAGAGCCACCCAAAGAGCATGCTGAGTTTGTATGAAGCTTCATATCTGAGAACACACGGAGAAACCATATTAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991899
ATGGATGTGGAAGGGAAATTCCAAGAGAGCATTAAGAGCCACCCAAAGAGCATGCTGAGTTTGTATGAAGCTTCATATCTGAGAACACACGGAGAAACCATATTAGACGACGCGCTTGCTTTTACTACGGCCACTCTGAAATCCATGGTGCCAAACCTCGGATCGCCCCTCAAGAAACAAGTTGTTCATGCCCTCGTGCAGCCCTTGCATTTGGGACTTCCTCGAGTTGAAGTGCGCAGTTTCATCTCCATCTATGAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772335.1
MDVEGKFQESIKSHPKSMLSLYEASYLRTHGETILDDALAFTTATLKSMVPNLGSPLKKQVVHALVQPLHLGLPRVEVRSFISIYEEEDHKNETLLKFTKLDYNLLQMIHKEELRQVSRWWKELGLMSKYPYARDRLVECFFWAVGVYHEPQYSLARIMLTKTIAMTSVIDDTYDAHATIEELDVFTEAIFF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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