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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003311`

染色体: Chr01 坐标: 51791498-51793540 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003311`
名称	SmilChr01G003311
描述	polyphenol oxidase I, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	51791498 - 51793540 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991904`
GeneID	`130991904`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991904`
原始查询	`LOC130991904`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	polyphenol oxidase I, chloroplastic-like
产物	polyphenol oxidase I%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os04g0624500` (Ph=Bhc(Po)) - identity=43.8; qcov=0.931; evalue=2.77e-128; confidence=medium
GO	GO:0004097 (catechol oxidase activity); GO:0046148 (pigment biosynthetic process)
KEGG	smil00350 (Tyrosine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00950 (Isoquinoline alkaloid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00264 (Tyrosinase); PF12142 (PPO1_DWL); PF12143 (PPO1_KFDV)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991904

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057772343.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.60000	`XP_057772343.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057772343.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772343.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772343.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:51791961`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B90,B92,B94,C80
`Chr1:51792069`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B75
`Chr1:51792200`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B4,C31,C36
`Chr1:51792370`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr1:51792600`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6
`Chr1:51792687`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B17
`Chr1:51792687`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B17
`Chr1:51792689`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	50	A15,A2,A5,A7,A9,B103,B111,B117,B124,B128,B130,B132,B136,B15,B22,B23,B26,B30,B38,B39,B45,B50,B55,B56,B57,B65,B7,B73,B79,B81,B89,B94,B95,C10,C19,C21,C31,C36,C39,C41,C43,C53,C54,C56,C64,C65,C78,C79,D2,D9
`Chr1:51792693`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	49	A15,A2,A5,A7,A9,B103,B111,B117,B124,B128,B130,B132,B136,B15,B22,B23,B26,B30,B38,B39,B45,B50,B55,B56,B57,B65,B73,B79,B81,B89,B94,B95,C10,C19,C21,C31,C36,C39,C41,C43,C53,C54,C56,C64,C65,C78,C79,D2,D9
`Chr1:51792706`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C7
`Chr1:51792706`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C7
`Chr1:51792819`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	58	A10,A11,A20,A21,A23,B10,B102,B109,B11,B112,B12,B122,B125,B14,B2,B24,B3,B36,B39,B41,B46,B47,B48,B49,B51,B53,B55,B59,B6,B69,B71,B76,B79,B82,B86,B89,B9,B91,B92,C11,C25,C3,C31,C36,C39,C4,C50,C6,C60,C7,C72,C73,C78,C80,C83,D11,D5,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772343.1

567 aa

284

567

Tyrosinase

PPO1_DWL

PPO1_KFDV

PF00264 Tyrosinase 158-364 aa PF12142 PPO1_DWL 373-422 aa PF12143 PPO1_KFDV 445-562 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772343.1`	Pfam	`PF00264`	Tyrosinase	Domain	158	364	4e-32	113.0	Common central domain of tyrosinase
`XP_057772343.1`	Pfam	`PF12142`	PPO1_DWL	Domain	373	422	2.8e-22	78.9	Polyphenol oxidase middle domain
`XP_057772343.1`	Pfam	`PF12143`	PPO1_KFDV	Domain	445	562	3.7e-31	108.6	Chloroplastic Polyphenol Oxidase C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916360.1
TATATATATACGTGCATCGATCCATTGTAGTAAGCATTAAGCAACACCAGCTAGCCATGGCTTCTTCCCTTATTGCTTCATGCACGGTGCTCTCCACCACCAACCCCCGCCACCGCATTGCATCCACCAATAATATTGCAAGGCGGAGCCGCCGCTTCCACGTCTCATGCAACGCCGCCGACGACAAAGAAGGGAGGGTGGACCGCAGAAACATGCTCCTCGGCCTCGGCGGCCTCTACGGCGCCACCAACCTCATCCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991904
ATGGCTTCTTCCCTTATTGCTTCATGCACGGTGCTCTCCACCACCAACCCCCGCCACCGCATTGCATCCACCAATAATATTGCAAGGCGGAGCCGCCGCTTCCACGTCTCATGCAACGCCGCCGACGACAAAGAAGGGAGGGTGGACCGCAGAAACATGCTCCTCGGCCTCGGCGGCCTCTACGGCGCCACCAACCTCATCCTCCCCGACCTCAACGCCTACGCCGACCCCATCCAGCCTCCGGAGTTCAAGTCCTGCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772343.1
MASSLIASCTVLSTTNPRHRIASTNNIARRSRRFHVSCNAADDKEGRVDRRNMLLGLGGLYGATNLILPDLNAYADPIQPPEFKSCGAAHEFKTGDPLDVNCCPPVSIADIVDYKLPTVTKLRRRQPAHRLSQSNIAKYEEAMRLMRELDVTDPDDPRGFTQQANIHCAYCNGAHDQLGFPGLDLSVHYSWIFFPFHRWYLYFYERILGSLIGDPDFALPFWNWDNPKGMQLPAIFDNPDSPLYDANRNQDHRPPAIANL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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