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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000587`

染色体: Chr07 坐标: 4013198-4014023 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000587`
名称	SmilChr07G000587
描述	phylloplanin-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	4013198 - 4014023 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991918`
GeneID	`130991918`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991918`
原始查询	`LOC130991918`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phylloplanin-like
产物	phylloplanin-like
Arabidopsis	`AT3G16660` (AT3G16660) Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820918] identity=55.4; qcov=0.801; evalue=6.67e-36; confidence=medium
Rice	`Os07g0674400` (P0618H09.12) - identity=42.3; qcov=0.815; evalue=4.45e-20; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF30918 (Phylloplanin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991918

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057772354.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772354.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772354.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772354.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772354.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:4013325`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B90,B92,C21
`Chr7:4013460`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B38,B39
`Chr7:4013460`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr7:4013478`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,C61,C62,C70
`Chr7:4013505`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr7:4013514`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B55,B93
`Chr7:4013542`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B61,C31,C55,C63
`Chr7:4013577`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B61,C31,C63
`Chr7:4013854`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	A3,B129,B13,B68,B69,B82,C28,C41,C54,C81,C9,D1
`Chr7:4013877`	`T`	`TAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	A1
`Chr7:4013877`	`T`	`TAG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	A1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772354.1

151 aa

151

Phylloplanin

PF30918 Phylloplanin 30-150 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772354.1`	Pfam	`PF30918`	Phylloplanin	Family	30	150	1.4e-53	181.0	Phylloplanin antifungal protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916371.1
CAAGTTTGTAAAAGAAATCAACACACCAACTACAATTAATATACCAAAATGGGCTTCAAATATCTAGTTTTGATTAGCCTCTTAGTTGCATTGCCATTTGCTCAACCACAATTGCTTGGTGGGATTCTAGGCCCTCTTTTGGGCCTACTTAAAATCCAAGGGATTCTTTATTGCACTCCTAATGGCAACATTGGTGTCAATGGCACTTCCACTCCTGTTTTTCCTAATGCACTGGTGCAGCTGCAGTGTGGTGGGACTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991918
ATGGGCTTCAAATATCTAGTTTTGATTAGCCTCTTAGTTGCATTGCCATTTGCTCAACCACAATTGCTTGGTGGGATTCTAGGCCCTCTTTTGGGCCTACTTAAAATCCAAGGGATTCTTTATTGCACTCCTAATGGCAACATTGGTGTCAATGGCACTTCCACTCCTGTTTTTCCTAATGCACTGGTGCAGCTGCAGTGTGGTGGGACTGTAGTATCTACCGCCGTGACAAACGGGTCGGGTCTATTCTCGATACTGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772354.1
MGFKYLVLISLLVALPFAQPQLLGGILGPLLGLLKIQGILYCTPNGNIGVNGTSTPVFPNALVQLQCGGTVVSTAVTNGSGLFSILLNPVNFLLSTLISGCKLVVNTPLASCNATLPSVGGLVSELQFIGNTLLGFLNIQNLIPSGFRIVN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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