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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000680`

染色体: Chr07 坐标: 4623885-4624726 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000680`
名称	SmilChr07G000680
描述	mitochondrial metalloendopeptidase OMA1-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	4623885 - 4624726 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991922`
GeneID	`130991922`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991922`
原始查询	`LOC130991922`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mitochondrial metalloendopeptidase OMA1-like
产物	mitochondrial metalloendopeptidase OMA1-like
Arabidopsis	`AT5G51740` (AT5G51740) Peptidase family M48 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835248] identity=49.2; qcov=0.863; evalue=2.61e-30; confidence=medium
Rice	`Os02g0735100` - identity=44.7; qcov=0.82; evalue=1.51e-27; confidence=medium
GO	GO:0004222 (metalloendopeptidase activity); GO:0016020 (membrane); GO:0051603 (GO:0051603)
KEGG	-
Pfam	PF01435 (Peptidase_M48)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991922

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057772360.1`
2	Lipid droplet	脂滴	0.20000	`XP_057772359.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772359.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772359.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772359.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:4623957`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B72,C83
`Chr7:4623992`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	23	A4,A7,A9,B102,B111,B112,B127,B137,B22,B27,B30,B50,B51,B57,C15,C26,C3,C44,C53,C6,C7,C79,D3
`Chr7:4623994`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	26	A10,A11,A13,A18,A2,A5,B106,B108,B122,B126,B25,B65,B73,B75,B95,C16,C20,C33,C37,C47,C58,C62,C64,C66,C78,C85
`Chr7:4623997`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	38	A19,B1,B100,B114,B115,B117,B121,B124,B132,B134,B16,B26,B3,B34,B36,B45,B47,B61,B63,B64,B69,B74,B76,B83,B90,B92,B93,C21,C24,C25,C31,C43,C56,C72,C9,D6,D7,D9
`Chr7:4624018`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	A24,B123,B129,C61
`Chr7:4624018`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	4	A24,B123,B129,C61
`Chr7:4624021`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	A24,B123,B129,C61
`Chr7:4624021`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	4	A24,B123,B129,C61
`Chr7:4624045`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	36	B1,B109,B123,B13,B133,B14,B2,B21,B29,B34,B37,B40,B53,B62,B68,B78,B80,B91,B98,C11,C13,C16,C21,C27,C30,C34,C42,C48,C49,C52,C56,C6,C69,C75,C80,D4
`Chr7:4624079`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	21	A1,A13,B105,B129,B18,B28,B70,B8,B80,B82,B84,C18,C25,C28,C47,C53,C54,C61,C70,C9,D1
`Chr7:4624114`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	35	B1,B109,B123,B13,B133,B14,B29,B34,B37,B40,B57,B62,B68,B78,B80,B87,B91,B98,C11,C13,C16,C21,C27,C30,C34,C42,C48,C49,C52,C56,C6,C69,C75,C80,D4
`Chr7:4624153`	`G`	`GGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B14,B21,C5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772359.1

140 aa

140

Peptidase_M48

PF01435 Peptidase_M48 37-107 aa

XP_057772360.1

139 aa

139

Peptidase_M48

PF01435 Peptidase_M48 36-106 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772359.1`	Pfam	`PF01435`	Peptidase_M48	Domain	37	107	1.3e-07	32.4	Peptidase family M48
`XP_057772360.1`	Pfam	`PF01435`	Peptidase_M48	Domain	36	106	2.5e-09	38.0	Peptidase family M48

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916377.1
ATGGTGTTACAAGGCACACTGCTGAAACCATCTCTACAGATCCGTGGCTTATGGCGGCGGTGTTGATAGAAGAAATGATTAAAGAGACGTGGCTGAACTTCTTAATGCATTTTATTCGCGTCTGGTTTTTGGAACCTGATATTGTTGTCGACAAAGTATTAGATCTCTTCCTAAGGCTTCCTCATTCTCGGAGGACGGAGATGGAAGCAGATTACATCGGACTTATGGTAATGGCTTCTGCAGGGTATGATCCTCGAAAA...

XM_057916376.1
ATGGTGTTACAAGGCACACTGCTGAAACCATCTCTACAGATCCGTGGCTTATGGCGGCGGTGTTGATAGAAGAAATGATTAAAGAGACGTGGCTGAACTTCTTAATGCATTTTATTCGCGTCTGGTTTTTGGAACCTGATATTGTTGTCGACAAAGTATTAGATCTCTTCCTAAGGCTTCCTCATTCTCGGAGCAGGACGGAGATGGAAGCAGATTACATCGGACTTATGGTAATGGCTTCTGCAGGGTATGATCCTCGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130991922
ATGGCGGCGGTGTTGATAGAAGAAATGATTAAAGAGACGTGGCTGAACTTCTTAATGCATTTTATTCGCGTCTGGTTTTTGGAACCTGATATTGTTGTCGACAAAGTATTAGATCTCTTCCTAAGGCTTCCTCATTCTCGGAGGACGGAGATGGAAGCAGATTACATCGGACTTATGGTAATGGCTTCTGCAGGGTATGATCCTCGAAAAGCTCCCCTTGTGTGGAAGAAGTTTGAAGAAATGAGTGAAACTTCATTATT...

LOC130991922
ATGGCGGCGGTGTTGATAGAAGAAATGATTAAAGAGACGTGGCTGAACTTCTTAATGCATTTTATTCGCGTCTGGTTTTTGGAACCTGATATTGTTGTCGACAAAGTATTAGATCTCTTCCTAAGGCTTCCTCATTCTCGGAGCAGGACGGAGATGGAAGCAGATTACATCGGACTTATGGTAATGGCTTCTGCAGGGTATGATCCTCGAAAAGCTCCCCTTGTGTGGAAGAAGTTTGAAGAAATGAGTGAAACTTCATT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057772359.1
MAAVLIEEMIKETWLNFLMHFIRVWFLEPDIVVDKVLDLFLRLPHSRSRTEMEADYIGLMVMASAGYDPRKAPLVWKKFEEMSETSLLGDFISTHPSCEKRCRLLSQPQVMEEALAIYRDMLPTSWSAMARLWLDNLIKP

XP_057772360.1
MAAVLIEEMIKETWLNFLMHFIRVWFLEPDIVVDKVLDLFLRLPHSRRTEMEADYIGLMVMASAGYDPRKAPLVWKKFEEMSETSLLGDFISTHPSCEKRCRLLSQPQVMEEALAIYRDMLPTSWSAMARLWLDNLIKP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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