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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000617`

染色体: Chr07 坐标: 4184793-4186541 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000617`
名称	SmilChr07G000617
描述	40S ribosomal protein S21-2
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	4184793 - 4186541 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991939`
GeneID	`130991939`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991939`
原始查询	`LOC130991939`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	40S ribosomal protein S21-2
产物	40S ribosomal protein S21-2
Arabidopsis	`AT5G27700` (AT5G27700) Ribosomal protein S21e [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832832] identity=85.19; qcov=0.988; evalue=2.79e-50; confidence=medium
Rice	`Os03g0345200` (RPS21) - identity=80.49; qcov=1.0; evalue=8.59e-49; confidence=medium
GO	GO:0000447 (endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)); GO:0000461 (endonucleolytic cleavage to generate mature 3'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0022627 (cytosolic small ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01249 (Ribosomal_S21e)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991939

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057772378.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057772378.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057772378.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057772378.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:4185685`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr7:4186362`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B14
`Chr7:4186362`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772378.1

82 aa

Ribosomal_S21e

PF01249 Ribosomal_S21e 1-77 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772378.1`	Pfam	`PF01249`	Ribosomal_S21e	Family	1	77	9.2e-40	135.4	Ribosomal protein S21e

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916395.1
TTTGTTACGTGCTCTCTCTACACTTTGGGGCCTGGGGCTATTTTTTTGTTGGTAAGTTATAAGTAGATTTAATATTGTAAAATTGGTAATAAAAATCATGATGGGCTCAATTCATAATGCCGAGATCCGGGCCTAAACACTCGGCCCAATCAGTATTCGGGCCTATAAATTGCAGGATTCAAGAAATTAGGTTTTACTCGTCGTTCACCATCCGTTGACTGCTCTGCTCTTCTTCTCCAGCTGAGATATTAATCAGTCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080393.1_cds_XP_057772378.1_35183
ATGCAGAATGAAGAGGGGCAAAATATGGATCTTTACATCCCGCGGAAATGTTCTGCTACCAACCGTCTGATTACGTCCAAGGATCATGCTTCGGTGCAGCTTAACATCGGACATGTGGATGAGAAGGGCGTTTACACGGGCCAATTCTCTACGTTTGCCCTATGTGGTTTCATCCGTGCCCAGGGTGATGCTGACAGTGCTTTGGATCGCCTCTGGCAGAAGAAGAAAGTCGAGGCCCGACAACAGTAG

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772378.1
MQNEEGQNMDLYIPRKCSATNRLITSKDHASVQLNIGHVDEKGVYTGQFSTFALCGFIRAQGDADSALDRLWQKKKVEARQQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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